蛋白质突变是指蛋白质氨基酸种类或序列发生改变，这种突变会进一步导致蛋白质结构和功能发生改变。蛋白质突变可能是自然发生的，也可能是人为引起的。蛋白质突变分析主要通过对比正常蛋白质与突变蛋白质之间的差异，揭示突变对蛋白质结构、稳定性、功能及其与其他分子之间相互作用的影响。在生物技术和药物设计领域，突变分析...
蛋白质突变是指蛋白质氨基酸种类或序列发生改变,这种突变会进一步导致蛋白质结构和功能发生改变。蛋白质突变可能是自然发生的,也可能是人为引起的。蛋白质突变分析主要通过对比正常蛋白质与突变蛋白质之间的差异,揭示突变对蛋白质结构、稳定性、功能及其与其他分子之间相互作用的影响。在生物技术等领域,突变分析有助于理解...
针对于此,上海交通大学自然科学研究院/物理天文学院洪亮教授课题组联合上海人工智能实验室青年研究员谈攀,以及上海科技大学和中科院杭州医学院的合作者,共同开发出了一种新的蛋白质序列大语言模型预训练方法 PRIME,同时在蛋白质突变-活性和突变-稳定性预测,以及其他温度相关的表征学习上取得了最佳预测效果。 相关研究以「...
打破传统蛋白质进化方法局限性：MIT团队设计新型蛋白质大模型，发现比自然界高效百倍的突变体 来源：DeepTech深科技 “我们通过少量实验数据和高效的计算模型显著提升了蛋白质活性，标志着蛋白质工程领域的一次重要突破。”谈及和团队近期发表在 Science 的论文，美国麻省理工学院博士生姜凯议如是说。研究人员结合蛋白质大...
该研究引入了蛋白质突变效应预测因子 (ProMEP),这是一种多模式且无 MSA 的方法,可以对突变效应进行零样本预测。为了准确预测突变的影响,研究首先开发了一个深度表示学习模型作为 ProMEP 的基础模块,该模型通过利用 AlphaFold 蛋白质结构数据...
研究发现，蛋白质突变的影响遵循相对简单的数学规则，大多数突变是独立起作用的，相互作用较为罕见。这一发现颠覆了以往认为突变间存在复杂交互作用的观点，表明可以通过简单的数学模型和精确的测量来预测蛋白质的行为。研究团队生成了数千种不同突变组合的蛋白质变体，并测试了它们的稳定性。实验结果显示，假设突变效应...
确定蛋白质突变顺序以制定精准诊断策略。分析突变顺序来探究蛋白质新功能的起源。有助于发现调节蛋白质表达的突变顺序。识别引起蛋白质亚细胞定位改变的突变顺序。为开发针对特定突变顺序的药物打基础。 研究突变顺序对蛋白质翻译后修饰的影响。利用突变顺序信息优化蛋白质工程改造。明确蛋白质突变顺序与疾病严重程度的关联。
蛋白质突变有多种不同的方式,包括点突变、插入、缺失、倒位等。 点突变是指单个核苷酸被替换为另一种核苷酸,导致一个氨基酸被替换为另一个氨基酸。点突变可以是同义突变,即替换后的氨基酸与原来的氨基酸相同,也可以是错义突变,即替换后的氨基酸与原来的氨基酸不同。 插入和缺失是指基因序列中插入或删除一个或多个...
研究蛋白质功能与序列的关系,传统的方法采用生化验证的结果结合生物信息学分析,但自然界中所能观察到的突变数量有限,且主要为有功能的(也有一些疾病相关的功能缺失突变数据),难以覆盖庞大序列空间的各种可能,对理解功能与序列的本质关联(物理规律)进而指导...