通常情况下,液液相平衡曲线呈现出一个S形状的曲线,曲线上半段表示半成分的蛋白质分布在水相中,而曲线下半段则表示半成分的蛋白质分布在有机相中。 蛋白质液液相分离可以通过调节介质的pH值来实现。在pH值低于蛋白质的等电点时,蛋白质通常呈现出正电荷,而在高于等电点时则呈现出负电荷。因此,通过控制溶液中的...
图1研究蛋白质“液-液相分离”的计算方法: 从左至右分别是解析模型、粗粒化模型(包括多个残基单个粒子、单个残基单个粒子、单个残基多个粒子的模型)和全原子模型, 分辨率的提升对计算资源的耗费程度急剧增高, 而模型假设数的减少会减弱研究涌现行为的能力[35] ...
蛋白质液-液相分离(LLPS)是细胞内多种功能的基础,对于分析细胞功能、治疗疾病和设计新型生物材料具有重要意义。研究者们已经识别出多个推动蛋白质LLPS的序列特征,并将其概括为LLPS的“分子语法”。本文进一步探…
主要研究内容如下:(1)针对自发生液-液相分离现象的蛋白质,本文根据LLPSDB数据库中液-液相分离蛋白的浓度是否小于100μM的实验条件,将发生液-液相分离现象的蛋白分为强液-液相分离和弱液-液相分离两类数据.然后将七种序列特征,四种进化信息特征和三种嵌入特征分别与五种传统机器学习方法构建模型,将四种进化信息特征与...
新民晚报讯(记者 郜阳)生物大分子(蛋白质和RNA)的液液相分离(LLPS)是近几年来国际生命科学领域的一个新兴热点。中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱继东课题组与刘聪课题组合作,首次发现了非受体酪氨酸磷酸酶SHP2在人类发育性疾病,如努南综合征和豹皮综合征中的基因突变能够导致SHP2蛋白的异常液...
可以通过蛋白质中的低复杂度(lc)结构域促进的液-液相分离(llps)与医学意义在生理学上高度相关;例如,影响蛋白质的llps能力的突变可以驱动神经退行性疾病如肌萎缩性侧索硬化症(als)和泛素阳性额颞叶变性(ftld-u)的发病机制。我们的研究小组探索被像贻贝、藤壶和沙堡蠕虫那样的海洋生物使用的锚定斑块启发的生物启发的...
对于蛋白质的分离和纯化,常常采用反相色谱法,因为蛋白质本身具有丰富的氢键和疏水性等特性,可以与填充物表面发生相互作用,从而实现分离和纯化的目的。 具体的实验步骤如下: 第一步:样品制备。将待测蛋白样品以适当浓度溶于纯化缓冲液中,并进行前处理,如除去酶或其他杂质。 第二步:液相色谱柱的选择。根据所需要纯化...
在将蛋白质混合物分离这个步骤中，高效液相色谱法与制备型等电聚焦电泳法（IEF）一样有用。高效液相色谱的优点是分离方式多种多样。串联高效液相色谱分离可以结合两种不同类型的色谱法。例如，先进行强阳离子交换，然后反相离子交换，应用到的是两种完全不同的分离模式。在后面文章中会介绍到的肽的高效液相色谱分析，...
图5:“液-液相分离”形成PAS的模式图。在营养丰富的条件下,Atg蛋白分散在细胞质中,与充满细胞质的各种蛋白质混合。当缺乏营养,Atg13去磷酸化时,Atg13会与其他Atg蛋白一起进行“液-液相分离”,在液泡膜上形成新的液相(液滴)。这...
蛋白质液-液相分离(Liquid-liquidphase separation,LLPS),是细胞内众多无膜细胞器(membraneless organelles)和生物分子凝聚体(biomolecular condensates)动态组装的主要驱动力。鉴定相分离蛋白需要多种实验,其中,体外重构相分离实验通过严格控制各种条件,可以更方便地研究相分离现象;而细胞内,尤其是生理条件下相分离现象的鉴...