有实验室利用该技术成功区分了两种空间结构不同的O-GlcNAc修饰位点,这在常规质谱中是无法实现的。 这些实践经验表明,做好质谱蛋白质修饰分析需要建立系统思维。从样本制备到仪器操作,从数据解析到结果验证,每个环节都可能成为瓶颈。某实验室总结五年来的项目数据发现,约35%的实验失败源于前处理不当,28%源于参数设置...
常见的蛋白质翻译后修饰包括磷酸化、糖基化、乙酰化、甲基化和泛素化等。蛋白质翻译后修饰能赋予蛋白质组丰富的生物学功能,参与调节各项生命活动,如转录调控、细胞生长分化、蛋白转运以及胞间信号传导等。质谱分析蛋白质修饰就是利用质谱技术对翻译后修饰蛋白质进行鉴定,经翻译后修饰的蛋白质由于添加了相关的化学基团...
在peptides.xlsx文件中,每条肽段的修饰情况(如乳酸化)都在"Modifications (all possible sites)"列中明确标注,包括修饰类型、数量和具体位置。例如,"2xLactylation "表示在肽段的第4和第5个氨基酸残基上发生了两次乳酸化修饰。这些数据可以直接用于确定蛋白质的翻译后修饰。此外,"# PSMs"列显示了每个肽段的谱图...
先看质谱图的整体,横坐标是肽段的质荷比(m/z值),纵坐标是质谱信号强度。峰越高,说明那个质荷比的离子越多。 接着,你要留意那些特别的峰,它们可能代表蛋白质上的修饰。比如,某个氨基酸被氧化了,分子量就会增加,质谱图上就会出现一个新的峰。 还可以看看二级质谱图,它能提供更详细的信息。比如,肽段的一级...
质谱检测是分析蛋白质翻译后修饰(PTM)的重要工具。翻译后修饰是指在蛋白质合成后发生的各种化学改变,这些改变对蛋白质的功能、定位和活性有重大影响。常见的翻译后修饰包括磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化等。在质谱分析中,蛋白质样本首先通过酶切被分解成较短的肽段。这些肽段被送入质谱仪,在其中被电离成带...
准确检测蛋白质的修饰状态是蛋白组修饰研究的关键环节。以下是几种常用的关键方法:2.1 质谱技术 质谱技术是准确检测蛋白质修饰状态的重要方法之一。通过质谱技术可以确定修饰的类型、位置以及修饰的丰度。质谱技术的发展使得蛋白质修饰的分析更加高效和精确。2.2 免疫沉淀 免疫沉淀是一种常用的靶向分析方法,通过特异性...
翻译后修饰蛋白组分析 其他相关服务 特色项目 一、蛋白测序 百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap FusionLumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析,N端测序,C端测序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对...
蛋白质翻译后修饰(post-translational modifications, PTMs) 是指在翻译后的蛋白质氨基酸侧链及其C/N末端引入新的基团(如磷酸基、乙酰基等)。PTM在细胞分化、蛋白质降解、信号传导和调节、基因表达调节以及蛋白质互作过程中起着关键作用。 液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)技术是进行蛋白质修饰鉴定的首选技术,可以同时实...
免疫沉淀(Immunoprecipitation,IP)和质谱检测蛋白质翻译后修饰将免疫沉淀技术与质谱技术结合起来,可以同时实现翻译后修饰蛋白质的获取和后续鉴定两部分工作。IP技术利用抗体与抗原特异性结合的原理可以将目标蛋白从混合物中分离提取出来,因此可以用于从蛋白混合物中分离特定的翻译后修饰蛋白。将能与目标翻译后修饰蛋白特异性结...
第一章:蛋白质修饰的重要性 蛋白质修饰是生物体内的一种常见现象,它通过改变蛋白质的化学性质,影响蛋白质的功能和活性。乙酰化和磷酸化是两种常见的蛋白质修饰方式,它们在许多生物过程中起着关键作用,如信号传导、基因表达调控等。第二章:质谱技术在蛋白质修饰检测中的应用 质谱技术是一种能够精确测量分子质量的...