4个预测蛋白互作网站。#热门 #干货分享 #sci #医学 #科研 @DOU+小助手 - Sci宝藏女孩⭐️于20240723发布在抖音,已经收获了426个喜欢,来抖音,记录美好生活!
1. Hitpredict网站收集了IntAct, BIOGRID 和 HPRD数据库中的由高通量实验或者是小规模实验得到的蛋白质互作关系,综合了三大数据库的内容,数据准确全面。此外,还有根据互作得分估计的蛋白质相互作用。 2. 目前为止,网站已经收集了人类,小鼠等9个物种的蛋白质...
1. CASTp 网址:http://sts.bioe.uic.edu/castp/ 网站打开缓慢,可预测蛋白活性位点。2. ConSurf...
01plant.MAP 其网站的网址:http://plants.proteincomplexes.org/,包含拟南芥、水稻、玉米等常见的模式植物的蛋白质数据。查找蛋白互作也非常简单,但是据很多同学反映,数据拟南芥的是最齐全,其他物种数据不是非常齐全,大家可以参考学习一下。操作步骤也非常简单,大家按要求输入ID名字就可以得到具体结果。02BioGRID ...
⑦STRING:STRING是一个蛋白质互作关系数据库,整合了多种数据源的蛋白质互作信息,包括实验验证的互作、计算预测的互作和文献报道的互作。它提供了蛋白质互作网络的可视化和分析工具,用于研究蛋白质相互作用网络和功能模块。STRING: https://string-db.org/ ⑧InterPro:InterPro是一个蛋白质家族和结构域注释数据库,...
蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)是指两个或两个以上的蛋白质分子通过非共价键形成蛋白质复合体(protein complex)的过程。 在进行数据挖掘时,比如你从GEO或者TCGA挖到一组自己感兴趣的差异表达基因,那么接下来如果想研究下这组基因的具体的某一个基因却又不知道无从下手的时候,这个时候PPI...
1. 效果展示 通过利用差异分析结果,使用STRINGdb包挖掘蛋白交互关系,使用visNetwork构建互作网络,并利用...
请收下这个网站 蛋白互作(Protein-protein interaction)大家肯定都不陌生,一般在探讨下游机制的时候常会被拿出来验证一把。蛋白互作的预测网站有很多,比如我们常用的String。这些网站通常只能预测正常的蛋白,而对融合蛋白(Fution proteins)互作却很少涉及,但是融合蛋白对肿瘤发展的重要性不言而喻,如下图所示。
导师给了三个预测蛋白互作网站:1,Genevestigator;2,Co-AT;3, AtPIN。可是都不会用。。。有谁会...
这个RNA与蛋白互作 不是测定分子间相互作用力吗 我们用仪器检测 亲和力大小强弱 预测的网站 不准吧~ bright8 有分子互做仪,直接测出来就好啦。 muchong5577 看看这个是否对你有帮助咯:http://swissmodel.expasy.org 根本扛不住 http://service.tartaglialab.com/page/catrapid_omics_group 这个网站,比较常用的一...