蛋白质分子的二级结构（secondarystructure）通常是指蛋白质多肽链沿主链骨架方向的空间走向、规则性循环式排列，或某一段肽链的局部空间结构，即蛋白质的二级结构为肽链主链或一段肽链主链骨架原子的相对空间盘绕、折叠位置，它并不涉及氨基酸残基侧链的构象。二级结构形式 蛋白质二级结构的基本类型有α螺旋、β折叠、β...
三级结构是指多肽链在⼆级结构的基础上,进⼀步盘绕、卷曲和 折叠,形成主要通过氨基酸侧链以次级键(有时还有⼆硫键和金属配位键)维系的完整的三维结构。 三级结构通常由模体 (motif)和结构域(domain)组成。 稳定三级结构主要包括氢键、疏⽔键、离⼦键、范德华⼒。 蛋⽩质构象 ⼀种蛋⽩质的全部三...
是在一个蛋白质分子内的相对独立的球状结构和/或功能模块,是由若干个结构模体组成的相对独立的球形结构单位,它们通常是独自折叠形成的,与蛋白质的功能直接相关。某些结构域在同一个蛋白质分子上被重复使用,某些蛋白质由多个拷贝的一种和多种结构域组成。 根据占优势的二级结构元件的类型,结构域可分为五类:(1)α...
蛋白质中第一个被提出的二级结构单元是α螺旋。 螺旋结构在生物分子中是很常见的(如 DNA 双螺旋)。α螺旋在球状蛋白中是相当常见的,平均起来,该类蛋白中有大概 30%的残基形成α螺旋的构型。 α螺旋是一种局域结构,它包含 5~40 个残基。这种呈现右手螺旋的结构对应于主链的Φ...
看到Alphafold的巨大power，去年暑假我的第一个想法就是用其预测p蛋白的结构。我们今天所用的所谓强效p蛋白逆转录活性抑制剂、慢性乙肝临床一线药物ETV、TDF等所谓强效抗乙肝药物的出身多是用于治疗HIV的药物，如果能够看到HBV、HIV逆转录酶结构域的异同，或许有助于理解临床上常见的与这些药物有关的低病毒血症何以发生...
1、蛋白质一、二级结构的概念 1)蛋白质的一级结构是指构成蛋白质的各种氨基酸在多肽链中由N端到C端的排列顺序。 主要化学键是肽键,少数含有二硫键。 Ø 一级结构是蛋白质空间构象(二、三、四级结构)和特异生物学功能的基础,但不是决定蛋白质空间构象的唯一因素。
多个蛋白质可以一起，往往是通过结合在一起形成稳定的蛋白质复合物，折叠或螺旋构成一定的空间结构，从而发挥某一特定功能。合成多肽的细胞器是细胞质中糙面型内质网上的核糖体。蛋白质的不同在于其氨基酸的种类、数目、排列顺序和肽链空间结构的不同。蛋白质由C(碳)、H(氢)、O(氧)、N(氮)组成，一般蛋白质可能...
蛋白质的二级结构(secondary structure)是指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,也就是该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。所谓肽链主链骨架原子即N(氨基氮)、Cα(α-碳原子)和Co(羰基碳)3个原子依次重复排列。蛋白质的二级结构主要包括α...