一些可用于蛋白质、肽和抗体序列分析和比对的最佳工具。 这些工具对于大分子领域的研究人员来说至关重要。 每个工具的概述及其应用: 随着分子生物学和生物信息学技术的不断发展,越来越多的蛋白质、肽和抗体序列数据被积累和发布。这些序列数据的分析和比对对于深入理解它们的结构、功能和进化具有重要意义,也为药物研发...
在本期文章中,我们将教你如何通过Uniprot网站,快速完成多物种蛋白序列比对和进化树构建。无需下载任何工具,全程在线完成,简单高效!✨ 步骤一:打开Uniprot并检索目标蛋白 打开uniprot网站:https://www.uniprot.org/输入你的目标蛋白名称。例如,我们以T2R41为例。直接点击Search按钮开始检索。 搜索目标蛋白 步骤二:选择...
蛋白双序列比对用于比对两条蛋白质序列,并找到最优的全局匹配方式。此工具用于查找序列保守区。 输入第二条序列(原始格式或FASTA格式),长度限定在2000以下。 >Human p53 SSSVPSQKTYQGSYGFRLGFLHSGTAKSVTCTYSPALNKMFCQLAKTCPV QLWVDSTPPPGTRVRAMAIYKQSQHMTEVVRRCPHHERCSDSDGLAPPQH LIRVEGNLRVEYLDDRNTFRHSVVVPYEPPE...
一些可用于蛋白质、肽和抗体序列分析和比对的最佳工具。 这些工具对于大分子领域的研究人员来说至关重要。 每个工具的概述及其应用: 随着分子生物学和生物信息学技术的不断发展,越来越多的蛋白质、肽和抗体序列数据被积累和发布。这些序列数据的分析和比对对于深入理解它们的结构、功能和进化具有重要意义,也为药物研发...
接着可以使用NCBI数据库中的BLAST在线工具(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)得到同源序列并下载完整的FASTA序列。 在上一个页面直接点击右边工具栏中的--Run BLAST,直接跳转到BLAST工具页面。 点击BLAST按钮,开始检索同源序列。 跳转到这个页面之后需要等一会才会出现结果页面,在线检索结果需要时间。
在我看来,COBALT是应该更加精确的。因为COBALT在多序列比对的同时,也用到RPS-BLAST, BLASTP, 和PHI-BLAST等工具,并且也用到了conserved domain database (CDD) 和PROSITE protein-motif database来保证COBALT比对结果的质量。最后比对的结果可以生成系统进化树。COBALT算是NCBI在线Blast功能的一个的延伸。
1. AlignmentViewer，一款直观易用的序列比对结果可视化工具，支持多样比对算法与格式。它对于快速识别序列相似性与差异，提供关键生物学分析依据。2. AbYsis，针对抗体序列进行深入分析，展现氨基酸分布与频率，着重显示少见残基，协助研究者确定抗体工程、药物设计与疾病研究的潜在变异方案。3. UniProt，作为集...
在线blast blast网站https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi Nucleotide BLAST 核酸序列到核酸库中的一种查询,库中存在的每条已知序列都将同所查序列作一对一的核酸序列比对。 Protein BLAST 蛋白序列到蛋白库中的一种查询,库中存在的每条已知序列将逐一地同每条所查序列作一对一的序列比对。
一般预测结构域的方法是利用2个以上的预测软件进行分析。我原来也回答过一个关于结构预测的问题，软件多为在线的，提交后网站会返回一个文件，要用特殊的软件来打开。当然既然是预测就有可能出现错误，更精确地方法就是用实验去验证，比如晶体衍射等方法。
国内专业音频分享平台,随时随地,听我想听!4亿用户选择的在线音频平台。马东、郭德纲、吴晓波等20多万大咖入驻,1亿多条原创有声内容覆盖有声书、儿童、相声评书、财经新闻、音乐等328类。