1.进入NCBI官网,选择protein,输入PDL1 2.选择references sequences protein 3.选择不同的转录本和物种(也可在一开始筛选物种) 4.(以第一个为例)点进去后往下翻,可以看到不同结构域的氨基酸序列和功能
蛋白质数据库是指专门存储蛋白质相关信息的数据库。它们收集、整理和存储大量的蛋白质数据，包括蛋白质序列、结构、功能、互作关系、表达模式、疾病关联等信息。蛋白质数据库提供了对这些数据的检索、查询和分析功能，为科学研究人员、生物信息学家和药物研发人员等提供了重要的资源。蛋白质数据库的内容通常来自于实验室...
点击你感兴趣的蛋白序列(通常以“NP_”开头),页面会跳转到该蛋白的详情页面,你可以在这里查看或下载蛋白序列信息。 例如,以查询小鼠的“SPP1”基因为例,你可以在NCBI主页选择“Gene”数据库,输入“SPP1”并点击搜索。在搜索结果中找到小鼠的“SPP1”基因记录,点击进入详情页面。然后下拉到“NCBI Reference Sequence...
对于蛋白质序列的查询，NCBI和EMBL都是很好的选择，但建议优先使用PDB。在PDB中，用户可以下载文件，然后利用各种专业的软件进行查看。通过这些软件，用户可以深入观察蛋白质的一级、二级乃至更高级的结构，甚至能够模拟蛋白质的结构变化。PDB数据库不仅提供结构数据，还包含详细的注释信息，帮助研究人员更好地...
用户只需输入感兴趣的蛋白质名称或序列,便能快速查询到该蛋白质的分子量(kDa),同时还能获得更多关于该蛋白质的详细信息;如基因背景、功能描述及相似蛋白质等。除此之外,NCBI(美国国立生物技术信息中心)地Protein数据库也是一个非常常用的平台。NCBI为用户提供了一个强大的搜索引擎,通过蛋白质序列或ID号进行查询便可...
查询基因的核苷酸序列(1)在pubmed gene数据库选择输入想要查询的基因,点击search即可。 (2)选择人类 (3)选择人FASTA (4)得到核苷酸序列 查询蛋白的氨基酸序列(1)首先得到基因的 UNIprotKB identifier …
上面有各种物种(包括植物)的蛋白详细信息,包括序列,结构,功能介绍,详细的annotation和分类,甚至列了很多相关publication参考文献(当然很多时候不全,需要另外查询,但可以参考,有一些列出来的文献自己找还未必能找到),最后还有一个protein interaction network,这个很强大,它是通过text mining的方式查找(有些基于实验结果)和...
2.选择:Nucleotide,输入物种拉丁名如Poria cocos 3.查询得如下: 4.选择该标题 5.进入之后就是一下画面, 6.点击下图中的FASTA, 7.进入之后就是以下内容,也是最终结果,其中,物种名为:Poria cocos ,登录号为:EF397600,基因序列为:GACCTCAG... 8.前面选择Protein,输入物种名如Poria cocos,搜索出来如下内容, ...
1. PIR和PSD PIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库，可在这里下载。这是一个全面的、经过注释的、非冗余的蛋白质序列数据库，其中包括来自几十个完整基因组的蛋白质序列...