ZINC 数据库是目前最大的有机小分子化合物库之一,不少类药分子的前期虚拟筛选都是基于这个数据库的。下面来看如何把该数据库下载到本地计算机。把整个数据库上亿个分子都下载下来是不明智的,以下根据特定的筛选标准,如logP 的范围等缩小了下载的分子数目在几十万个。你应当根据自己的项目需求灵活设定自己的过滤标准。
要下载ZINC数据库，首先应明确筛选标准，如logP范围等，以缩小下载的分子数目至几十万个，以适应项目需求。建议根据个人项目灵活设定过滤标准。请注意，数据库分子数量随时间增加，教程制作于2020年夏天，运行时实际分子数量将远大于教程显示的数量。下载后，你将获得包含数十个甚至上百个子文件夹的文件，每...