《虐杀原形》的游戏背景设定在现代的纽约,游戏的主角是一个漫画式的反英雄角色——Alex Mercer,游戏的主角患有健忘症,一次醒来之后发现完全不知道之前做了些什么。你需要利用主角的各种超能力来寻找他的过去。故事中主角Alex很有可能牵扯到政府的一些生化研究的最高机密。