基于对作者的NAU-LB组装基因组中具有NBS结构域的蛋白质序列的搜索(Pfam: PF00931),本研究共鉴定了110个NBS-LRR抗性基因(RsNBS001–RsNBS110),这些基因被聚类并分散到9条萝卜染色体中,其中Chr6包含最多的基因(22,20%)。系统发育分析显示,45和65个RsNBS基因分别分为CNL(CNL-A~CNL-D)和TNL(TNL-A~TNL-H)亚...
图1 高质量端粒至端粒胡萝卜基因组组装 结合基因组和转录组结果,研究重构了胡萝卜中类胡萝卜素代谢途径。共有65个与类胡萝卜素合成相关的结构基因被鉴定出来,其中有9个为胡萝卜T2T基因组特有的。基于胡萝卜T2T基因组中鉴定出的重复序...
胡萝卜，尤其是橙色胡萝卜含有大量类胡萝卜素，有助于降低患眼疾等疾病的风险。在美国人的饮食中，橙色胡萝卜是维生素 A 最丰富的植物来源。北卡州立大学的研究人员与威斯康星大学麦迪逊分校的同事合作，对 630 个胡萝卜基因组进行了测序，以继续研究橙胡萝卜的历史和驯化情况；这些研究人员在 2016 年发表在《自然-...
获得了具有高连续性、完整性和准确性的完整胡萝卜基因组,为胡萝卜的进一步分子研究提供了遗传学基础。 摘要 胡萝卜(Daucus carota)是一种伞形科植物,具有多色肉质根,为类胡萝卜素研究提供了模型系统。在这项研究中,我们组装了一个430.40 Mb的高质量无间隙基因组胡萝卜的端粒到端粒(T2T)基因组。总共鉴定出36 268...
萝卜是一种具有经济和生态重要性的十字花科蔬菜兼油料、饲料或药用作物,也是研究多倍化后基因组进化和渗入的模式系统。虽然已有利用二代和三代测序技术构建的萝卜基因组图谱,但单个基因组不能代表萝卜属中不同种、亚种和变种的全部遗传信息。为深入了解萝卜属物种间和物种内的遗传变异和基因渗入,本研究使用PacBio、Ill...
Hortic Res | 南京农业大学联合贵州农科院和淮阴工学院发表首个胡萝卜完整参考基因组并揭示类胡萝卜素积累特性 二、个人简介 熊爱生,博士生导师,南京农业大学园艺学院,主要从事蔬菜发育生物学、蔬菜功能基因组学、蔬菜基因工程等方面的研...
基因组测序:全面了解胡萝卜 ①曾有人预言下一个改变世界的技术不是大数据,不是人工智能,而是基因组测序。它不仅可以让我们了解生物的本源,还能够让我们更好地对生命进行“改造”。甚至可以说,这项技术将影响并改变我们的生老病死。 ②胡萝卜和生菜、芹菜属于植物中的一大类,但它质脆味美,更受大部分家庭主妇...
一、类胡萝卜素( carotenoids): 1.是有一系列共轭双键和甲基支链基本结构的一类高度不饱和化合物的总称,四萜化合物。典型的类胡萝卜素是由8个异戊二烯单位首尾相连形成。类胡萝卜素的颜色因共轭双键的数目不同而变化。共轭双键的数目越多, 颜色越偏向红色。 2.类胡萝卜素
几个世纪以来,人类在胡萝卜基因组中留下了印记。例如,开花使胡萝卜的主根木质化,不能食用,因此育种者选择了几种延迟开花时间的基因。他们还选择了三种导致类胡萝卜素积累的基因,这些基因有助于蔬菜的鲜艳颜色和营养价值。
高密度遗传图是探索新基因组信息、QTL定位以及农艺性状基因挖掘的重要的技术手段。然而关于萝卜中应用于定位重要性状基因或者检测重组事件的高密度遗传图的记录并不多。本研究利用全基因组重测序策略构建了包含9个连锁群,411891个SNP标记,全长1306.8cM的萝卜超高密度遗传图。针对11种园艺性状进行QTL定位,共检测到18个QTL...