（H，I）线性判别分析( LDA )效应值( LEfSe )显示ANIT + Vehicle组中肠杆菌科、肠球菌科、肠杆菌目、变形菌门和γ -变形菌门的丰度增加。GPS预处理显著阻止了ANIT诱导的肠道菌群变化。此外，GPS给药增加了胆汁淤积小鼠中拟杆菌属( Bacteroides )、噬气菌属( Gastranaerophilales )和毛螺菌科的丰度 16S rRNA...
LEfSe(LDA)分析可以直接对所有分类水平同时进行差异分析;同时,LEfSe更强调寻找分组之间稳健的差异物种,即标志物种。 LEfSe的分析结果包括两部分,分别是显著差异物种LDA值分布柱状图,用以展示每个组内显著富集的物种(注意不显示显著下调的)及其重要性程度,纵坐标为组间具有显著差异的分类单元,横坐标则以条形图直观地展示各...
为了确定重要的肠道菌群代谢产物相互作用,对两个数据集的差异标志物进行了相关性分析,结果显示出微生物群和代谢组数据集的两组标志物之间存在强烈相关性(图6F-G)。因此,这些数据证明了肠道菌群和代谢组之间的密切联系,以及研究肠道微生物代谢产物作为肠道菌群与宿主之间沟通媒介的必要性。 图6 多组学整合筛选CRC的关键...
LEfSe(LDA)分析可以直接对所有分类水平同时进行差异分析;同时,LEfSe更强调寻找分组之间稳健的差异物种,即标志物种。 LEfSe的分析结果包括两部分,分别是显著差异物种LDA值分布柱状图,用以展示每个组内显著富集的物种(注意不显示显著下调的)及其重要性程度,纵坐标为组间具有显著差异的分类单元,横坐标则以条形图直观地展示各...
图7. 肠道菌群与肠道屏障、肠道和海马炎症、HPA轴及血清代谢物的相关性分析 研究结论 研究结果表明，...
1.2 操作分类单元(Operational taxonomic units,OTUs)和扩增子序列变异(amplicon sequence variants,ASVs)OUT表的构建是标记基因(amplicon)数据分析的重要组成部分。OTU是根据相似性对细菌进行分类的一组序列,阈值通常设定为97%,即相似性达到97%的标记基因序列被认为是一个OTU。...
苹果腐烂菌群分析 苹果腐烂菌群分析 取腐烂苹果样品时，需选取不同腐烂程度、不同储存环境的果实。腐烂初期样品重点观察交界处菌群分布，完全腐烂样品采集中心区域。使用无菌操作台分离果皮与果肉，记录环境湿度、温度数据。注意同一批样品需包含未腐烂对照组。培养环节采用PDA培养基与LB培养基双盲对照。将果肉组织切碎后分别...
四、检验方法以及结果分析 4.1 多管发酵法 大肠菌群多管发酵法检验程序见图1。 图1 大肠菌群检验程序 4.1.1 矿泉水水源水检测 4.1.1.1 推测性检验 a) 吸取10mL水样接种到盛有10mL双料乳糖胆盐发酵培养液的试管中,共接种5份; b) 吸取1mL水样接种到盛有10mL单料乳糖胆盐发酵培养液的试管中,共接种5份; ...
以下是您的肠道菌群分析报告: 1.菌群组成 在我们的分析中,我们检测到了您肠道中主要的菌群组成。根据结果显示,您的肠道菌群主要包括乳酸菌、双歧杆菌、变形杆菌、放线菌等多种细菌。这些细菌在维持肠道健康、消化食物并促进免疫功能方面发挥着积极作用。 2.益生菌水平 通过分析,我们了解到您的益生菌水平。益生菌...