5~15次为较低重复次数,分布有36 634个SSR,占总数的71.15%,说明低重复次数是苦荞基因组SSR的主要特点之一;大于15次为较高重复次数,分布有14 851个SSR,占总数的28.85%,其中14 388个为二核苷酸重复;最高重复次数是95次。 图2苦荞基因组SSR重复次数分布Fig. 2...
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6 个 WOX 基因在苦荞和拟南芥之间存在基因组共线性.表达模式及相关性表明, FtWOX1/FtWOX12/FtWOX22/FtWOX23/FtWOX24 与苦荞出愈率存在正相关性.【结论】苦荞 FtWOXs 成员存在丰富的序列变 异特征,不同苦荞基因型中 WOX 基因表达水平及出愈率存在明显差异和一定的相关性,揭示不同苦荞 WOX 基因具有潜 在的功能...
【中外科学家联合构建苦荞基因组变异图谱,确认中国西南为栽培起源驯化中心】“一月开花,两月结果,三月收获。”长期以来,在我国西南彝区、边疆藏区和高海拔冷凉山区,苦荞是当地人的主要粮食。时至今日,苦荞作为重要的药食同源和健康养生作物,正受到都市人的青睐。北京时间2021年1月12日,《基因组生物学》(Genome ...
内基因结构 和蛋白质基序相对保守.基因重复分析表明,苦荞基因组中有 8 对 VQ 旁系同源基因,均为大片段重复基因,提示大片段基因 重复在 FtVQ 基因家族数量扩张中发挥主要作用;它们的非同义突变和同义突变的比值(Ka/Ks)均小于 1,提示重复基因在进 化中经历了纯化选择.启动子顺式元件预测表明,所有 FtVQ 基因启动...
北京时间2021年1月12日,《基因组生物学》(Genome Biology)在线发表了中外科学家联合构建的苦荞基因组变异图谱。 他们从分子水平上明确了我国西南地区作为全世界苦荞多样性中心和栽培起源驯化中心的独特地位。这为研究苦荞驯化和性状改良奠定了重要的理论基础。
通过与苦荞基因组比较发现,金荞麦基因组大小是苦荞基因组 (0.48G) 的两倍,这主要是由重复序列扩增导致。研究发现,在3号和4号染色体上存在两段大片段倒位,相关基因与代谢、细胞壁形成、根形态建成等密切相关,推测这可能与金荞麦特有的品质和农艺性状相关。基因组进化分析发现,金荞麦和苦荞在近代发生分化,金荞麦中与...
近日,记者从中国农科院作科所获悉,该所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队,牵头联合国内外10余家科研单位,对来自14个国家的510份苦荞核心资源的全基因组进行重测序,构建了苦荞基因组变异图谱,揭示了苦荞的起源和传播驯化路径,明确了我国西南地区作为全世界苦荞多样性中心和栽培苦荞起源驯化中心的独特地位。
图1 苦荞基因组circle图 2.系统发育和全基因组复制事件分析 苦荞与拟南芥、可可、大豆、葡萄、杨树、马铃薯、番茄以及单子叶的水稻和玉米构建系统发育进化树,见下图。此外还进行基因家族聚类分析,找出共同和特有的基因家族。 图2 苦荞系统发育进化树 通过苦荞与拟南芥、苦荞与甜菜进行分析,通过Ks计算发现苦荞经历了全基...
近日,记者从中国农科院作科所获悉,该所特色农作物优异种质资源发掘与创新利用创新团队,牵头联合国内外10余家科研单位,对来自14个国家的510份苦荞核心资源的全基因组进行重测序,构建了苦荞基因组变异图谱,揭示了苦荞的起源和传播驯化路径,明确了我国西南地区作为全世界苦荞多样性中心和栽培苦荞起源驯化中心的独特地位。