第一种计算方法:tidyverse方法 基本逻辑是根据across,批量提取y开头的性状,然后进行标准化,最后使用mutate进行修改。最后将权重对应的性状相乘,相加变为综合育种值。# 标准化d1 = d1 %>% mutate(across(starts_with("y"),scale))# 赋予权重d1 = d1 %>% mutate(index = y1*0.3 + y2*0.3 + y3*0.4)he...
上面公式中:标准误的计算方法是:标准误se(BLUP) = sqrt(CiiVe),这里面dVe就是个体BLUP值的标准误,现在遗传评估软件可以直接得出se。所以准确性的公式为:r = sqrt(1 - (Cii*Ve)/Va) = sqrt( 1 - se^2/Va),可靠性是准确性的平方,所以可靠性的计算为1 - se**2/Va 注意,上面没有考虑近交系数的影...
蛋鸡的生产性能也是蛋鸡育种值计算的重要因素之一。生产性能包括蛋鸡的产蛋量、蛋重、存活率、肉质等方面。在计算蛋鸡育种值时,需要对蛋鸡的生产性能进行评估,以确定蛋鸡的生产潜力。 3.蛋鸡的疾病抗性 蛋鸡的疾病抗性也是蛋鸡育种值计算的重要因素之一。疾病抗性包括蛋鸡对各种疾病的抵抗能力。...
首先,育种值的计算基于个体的遗传信息和性状表现数据。这一过程涉及收集有关目标性状的遗传数据,例如个体在不同环境下的生长性能、抗病性等方面的数据。这些数据为计算育种值提供了基础信息。其次,计算育种值的关键在于分析个体的遗传标记。遗传标记可以是单个基因位点的多态性信息,也可以是多个基因位点的...
所能固定的是基因的加性效应值,即育种值。从表型值估计育种值的公式是: 育种值 式中A为种畜某性状的估计育种值;bAp为该性状育种值对表型的回归系数,即遗传力加权系数;户为种畜该性状的表型值;为该性状的群体平均数。由于p和为已知,因此计算bAp是估计育种值的关键。下表列出的是用不同来源的记录资料计算bAp...
BLUP(Best Linear Unbiased Prediction)是一种常用的育种值估计方法,其中,A.A、B.Z或C.X通常用来标识个体间加性遗传方差协方差矩阵。总的来说,育种值的计算需要综合分析个体的亲缘关系、表型信息、遗传参数等。这些因素都需要通过专业的遗传学和统计学方法进行处理和分析。在实际应用中,育种值计算...
奶牛采食量育种值计算公式。奶牛的采食量受到多种因素的影响,包括奶牛的体重、体型、品种、生长发育情况、环境条件等。为了科学地评估奶牛的采食量,可以使用以下公式进行计算:奶牛采食量(kg/d)=体重(kg)采食系数(%)。其中,体重是指奶牛的体重,采食系数是指奶牛每日采食量与其体重的比值。采食系数是一个...
1,多个性状的育种值进行标准化 2,多个性状的育种值赋予权重 为何要进行标准化? 所谓标准化,就是将数据变为平均数为0,方差为1的数据集。将所有性状都标准化,就意味着这些性状的尺度都是一样的,是一个总体,可以进行加减乘除的操作。然后可以对不同的性质设置不同的权重,才可以进行综合育种值的计算。
育种值的准确性是衡量育种值计算质量的重要指标。准确性的高低反映了依赖于的遗传信息量,准确性高表示计算时使用的信息多,结果更可靠。准确性的计算公式为:r = sqrt(1 - (Cii*Ve)/Va),其中Cii代表个体方差组分,Ve代表误差方差组分,Va代表加性方差组分。可靠性则是准确性的平方。在比较不同性状...
全同胞家系如何计算遗传力和育种值,本篇介绍一下实现方法和代码。用到的软件有asreml和lme4。 示例数据和代码可以加入星球内自行下载。 1. 什么是全同胞家系 全同胞家系,由同父同母所生子女的集合体称为全同胞家系。 比如父本是A1,A2,A3,母本是B1,B2,B3,如果A1B1,A2B2,A3*B3,每个配对分别有10个后代,比如:...