常见的多重耐药菌有以下几种:耐甲氧西林金葡菌(MRSA)、超广谱β-内酰胺酶耐药菌(ESBLs)、耐万可霉素肠球菌(VRE)、耐万可霉素金葡菌(VRSA)、多重耐药性鲍曼不动杆菌(MRAB)、耐青霉素肺炎球菌(PRP)等。 下面我以一种常见的多重耐药菌——鲍曼不动杆菌为例,介绍如何分析多重耐药菌临床菌株基因组重测序数据和比较...
3.2 耐药基因分析示例 在对21 例样本耐药基因检测后,再结合各个样本检出的菌种类型、检出耐药基因的支持 read 数及耐药基因序列的覆盖率进行最终鉴定。当检出的耐药基因属于检出菌种且有较多 read 支持时,才认为其是可信耐药基因。判断标准为:tNGS 检出 unique reads 数 > 20,mNGS 检出 reads 需 > 1。tNGS 检测...
目的：根据铂耐药性相关（PRR）基因分析，识别分子亚型，并开发膀胱癌（BLCA）肿瘤免疫微环境（BLCA）的评分系统，同时确定P4HB作为潜在的治疗靶点。方法：作者分析了594个BLCA样本的基因表达数据和临床信息，使用无监督聚类来根据PRR基因的表达水平来识别分子亚型，进行了功能和通路富集分析，以了解这些亚型的生物活性。评...
本组数据反映的儿童耐药肺炎克雷伯菌的基因组分型及克隆传播特点为:NDM(48.5%)是从儿童分离的CRKP中流行最广的金属β内酰胺酶,特别是在重症监护病房中(79%);bla NDM-1-IncX3和bla NDM-1-IncN型质粒在儿童NDM的流行过程中起重要作用,其中,bla...
笔者重点从第1、2版《目录》差异入手,对《结核分枝杆菌耐药相关基因突变目录 (第2版)》进行解读。 一、优化分析流程 第2版《目录》相较于第1版,提供了更加集中、高效、开源、可持续的分析流程,以减少未来《目录》更新的工作量。在第1版《目录》中,所有表型/基因型药敏试验数据和所有计算过程,均基于访问受限...
专科分类:肿瘤科检查分类:基因检测(DNA) 适用性别:男女均适用是否空腹:空腹 参考价格:50—100元 分析结果: 温馨提示: 配合医生检查。 正常值 正常范围阴性。 临床意义 阳性: 1.判断肿瘤病人对当前化疗用药是否产生耐药。 2.在化疗前可指导临床用药,以便选择或制定化疗发案。 结果阳性可能疾病: 恶性肿瘤 、 涎腺...
深度挖掘:除了基本的耐药基因检测,AMRFinderPlus还可以进行耐药、毒力、质粒重构和表征、整合性可移动元件分析等功能,帮助我们更深入地挖掘微生物全基因组测序数据中的信息。 开源性质:作为一款开源软件,AMRFinderPlus鼓励社区参与,不断更新和完善数据库和软件,结合最新的科研成果,确保了结果的准确性和时效性。
进行耐药基因型数据库的分析通常需要以下步骤: 数据获取:首先,需要从公开数据库或文献中获取耐药基因型数据库的相关数据,这些数据通常以基因序列、蛋白质序列、表达数据等形式存在。 数据清洗与整理:获取数据后,需要进行数据清洗和整理,包括去除重复数据、修正错误数据、统一格式等,确保数据的准确性和一致性。
因此,研究菌株的耐药机制,进行耐药性基因的克隆和功能分析,对于设计和开发新型抗生素具有重要意义。 1.耐药性基因克隆的主要方法 目前,耐药性基因克隆的主要方法有限制性酶切和反转录聚合酶链反应(RT-PCR)等。 限制性酶切法是利用特定的限制性酶切酶在基因序列中特异性切割,将目标基因从源片段中割离出来。限制性...
抗菌素耐药性基因的分析是了解耐药性机制、研发新的抗菌素和开展个性化治疗的基础。研究表明,抗菌素耐药性主要通过垂直转移和水平转移两种方式在细菌中传播。垂直转移是指耐药基因从父代细菌传递给子代细菌,这是一个遗传过程;水平转移是指细菌通过质粒、整合子和转座子等介质将耐药基因传递给其他细菌,这是一种比较快速...