网络毒理学是指构建特定的网络模型,描绘研究对象的毒理学性质,应用网络剖析预测药物的毒性,从而了解药物对机体的毒副作用并预测药物的毒性成分。自Barabási等于2004年提出相关技术概念以来,网络生物学(networkbiology)已经成为当前生物医药研究的重要方法。这类研究大多采用无标度网络等网络建模技术,描述研究对象的复杂...
3、网络毒理学分析 3.1PM-D肝毒性靶点和网络构建 经药物靶点预测和疾病靶点收集共获得了30个目标靶点网络构建结果显示mTOR、PIK3CA、AKT1、EGFR、ERBB2、ESR1、RPS6KB1、CTNNB1是核心的相关靶点(图4)。图4 | 网络构建及靶点分析 (A)共同靶标集合 (B)药物-靶点-疾病网络 (C)PPI网络。3.2 GO和KEGG...
然而,综合网络药理学发展经验及多数网络毒理学实验设计来看,现阶段的网络毒理学研究方法尚不完善,存在方法套路化、学术思维固化、数据库更新缓慢、分析工具落后、数据使用欠规范、实验结果假阳性以及缺乏有效的结果验证等问题[5-8]。 以代谢组学、转录组学...
是不是简单的套路,但是文章的质量却很高,用生活中最常见的增塑剂,探讨了乳腺癌与增塑剂之间的复杂相互作用。网络毒理学研究思路因其发文量少、竞争小,且无需实验操作而备受青睐;而纯生信分析采用TCGA数据库、PPI网络和分子对接等常规套路,只需更换研究材料,即可轻松复现文章。感兴趣的朋友们赶紧收藏这个思路,跟随小云,...
网络毒理学+分子对接+乳酸化+实验机制解析!!! 题目:低水平暴露于BDE-47会通过TOP2A/LDHA/乳酸化正反馈回路促进前列腺癌的发展 英文名:Low level exposure to BDE-47 facilitates the development of prostate cancer through TOP2A/LDHA/lactylation positive feedback circuit...
1,研究采用网络毒理学和分子对接分析方法,对ATBC的潜在脑毒性进行了全面的分析。该方法结合了生物信息学、基因组学和大数据分析,快速、全面地揭示毒物与病理之间的复杂分子关系;2,通过网络毒理学和分子对接分析,鉴定了ATBC对大脑的潜在靶点;3,通过整合关键通路富集分析,揭示了ATBC对大脑的潜在毒性机制,为评估...
1.创新的网络毒理学思路:首先网络毒理学是个新研究方向,创新度较高、发文较少、竞争小,而且可以纯生信、不做实验~ 2.套路简单的纯生信:常规套路TCGA数据库+PPI+分子对接,这种方法的套路相对简单,通过改变研究的生物材料或疾病类型,文章轻松复现~ 看到这些熟悉的方法是否让你感到更加得心应手?如果你正在为毕业或职...
1,研究采用网络毒理学和分子对接分析方法,对ATBC的潜在脑毒性进行了全面的分析。该方法结合了生物信息学、基因组学和大数据分析,快速、全面地揭示毒物与病理之间的复杂分子关系; 2,通过网络毒理学和分子对接分析,鉴定了ATBC对大脑的潜在靶点; 3,通过整合关键通路富集分析,揭示了ATBC对大脑的潜在毒性机制,为评估潜在环境...
本工作旨在通过整合网络毒理学和空间代谢组学策略来探索PM-D的肝毒性机制。我们基于八种关键毒性成分的毒性靶点预测和肝毒性靶点集,构建了PM-D的肝毒性相互作用网络,后富集关键信号通路,并进行分子对接验证,评估有毒成分与核心靶点的结合能力;采用小鼠肝组织病理变化和血清生化检测方法评价口服PM-D对小鼠的肝损伤作用;...
1,研究采用网络毒理学和分子对接分析方法,对ATBC的潜在脑毒性进行了全面的分析。该方法结合了生物信息学、基因组学和大数据分析,快速、全面地揭示毒物与病理之间的复杂分子关系; 2,通过网络毒理学和分子对接分析,鉴定了ATBC对大脑的潜在靶点; 3,通过整合关键通路富集分析,揭示了ATBC对大脑的潜在毒性机制,为评估潜在环境...