首先,作者使用mIHC来量化同一医院另外27名结直肠癌肝转移患者中选定免疫细胞亚群的空间分布(图2D-F)。在未处理的样本中,作者观察到FOXP3+ Tregs、MRC1+ CCL18+巨噬细胞和SPP1+巨噬细胞在结直肠癌和肝转移中浸润显著增加,这与scRNA-seq数据基本一致(图2F)。作者探讨了TCGA中结直肠癌人群中scRNA-seq定义的免疫细...
1. CRC原发肿瘤和CRC肝转移瘤单细胞转录组揭示肿瘤细胞和免疫细胞之间的异质性 通过基于标记的注释,从非免疫细胞中识别出肿瘤细胞(EPCAM和SOX9)、成纤维细胞(COL1A1和COL1A2)和内皮细胞(PECAM1和CD34);从免疫细胞中鉴定出来T细胞(CD3.pAbO)、自然杀伤(NK)细胞(CD56.pAbO)、B细胞/浆细胞(CD19.pAbO)、单核细...
1、结直肠癌肝转移、原发性肝癌和原发性结直肠癌的免疫特征 研究者为了确定免疫细胞在肿瘤/癌旁组织抑或肝脏/结直肠的富集倾向性,利用团队早期发表数据中的18名未经治疗的原发性结直肠癌(colorectal cancer, CRC)患者和16名未经治疗的原发性肝...
1. 单细胞结合空间转录组数据精确量化结直肠癌肝转移肿瘤免疫微环境多样性 本研究通过10x Genomics单细胞技术共捕获了 178,630 个 CD45+ 细胞,平均每个样本包含2,007 个细胞,基因中位数为1064。经过细胞聚类分析,本研究定义了主要的细胞类型。与之前的结肠癌 scRNA-seq 基本一致。研究人员从 CRLM 样本中鉴定了髓...
研究背景在全球范围内结直肠癌（CRC）是第三大最常见的恶性肿瘤，约21~26%的患者会发生同步转移疾病，其中14.5~17.5%的患者会发生肝转移。转移的CRC往往预后很差，CRCLM导致巨大的临床挑战。转移过程是个多步骤事件，而癌细胞和基质细胞之间能够通过分泌可重塑肿瘤微环境（TME）的细胞因子、生长因子和蛋白酶进行...
肝转移仍然是结直肠癌患者长期生存的主要障碍,也是癌细胞的高度动态扩散途径。除癌细胞外,肝转移的肿瘤微环境(TME)具有高度的免疫抑制表型,诱导抗原特异性T淋巴细胞的全身性损失,并推动肿瘤的扩散。目前仍不清楚免疫细胞如何在空间上协调结直肠癌肝转移(CRLM)进展及转移细胞微环境是否与原发细胞不同。因此,迫切需要记...
1、CRC原发肿瘤和CRC来源的肝转移肿瘤的总体单细胞转录组图谱 为了阐明CRC原发肿瘤和CRC来源的肝转移肿瘤的细胞异质性,作者从六名CRC患者的原发结直肠癌(CC)、相邻正常结直肠粘膜(CN)、肝转移(LM)、相邻正常肝组织(LN)以及外周血(PB)中收集了CD45−非免疫细胞和CD45+免疫细胞进行单细胞转录组分析(图1A)。
方法:单细胞转录组测序 研究结果 1、CRLM、HCC和CRC的数据收集和不同的免疫特征 从101个匹配的CRLM样本中分选出CD45+细胞,包括原发性结直肠癌(Pri.CT)、邻近结肠(Adj.Col)、肠系膜淋巴结(MLN)、肝转移(Liv.Mets)、邻近肝脏(Adj.Liv) 和17名初...
伯豪生物全称上海伯豪生物技术有限公司,在生命科学领域为科研工作者提供技术支持及服务、科研试剂产品的公司。主营业务:单细胞测序、单细胞核测序、单细胞ATAC测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序、空间基因测序、空间转录组测序、FFPE空间转录组测序等,多组学科研技术服
郑悦媛承担的深圳市医学研究专项资金项目,项目名称:基于单细胞多组学的结直肠癌肝转移超级增强子调控机制研究”(批准号:B2402019)拟安排外拨经费97万元给广州医科大学,97万元给中山大学肿瘤防治中心。该科研项目负责人及相关人员与上述外拨单位不存在直接或间接的利害关系,并在此承诺若项目组故意隐瞒关联关系,其责任由...