本发明属于生物分析技术领域,具体为一种同时分析氨氧化或甲烷氧化相关细菌群落结构的分析方法.本发明步骤为:设计能同时覆盖颗粒性甲烷氧化酶α亚基基因和氨氧化单加氧酶α亚基基因的高简并加tag引物;利用此引物对环境样品中提取的基因组DNA进PCR扩增;利用barcode标记的tag引物对纯化过的第一步PCR产物进行PCR扩增;对...
摘要:建立了通过PCRDGGE研究钉螺体内细菌群落结构的方法,并采用此技术分析了钉螺体内细菌群落结 构。钉螺样本采自湖北省荆州市,样本带回实验室经破壳解剖后取清洗的钉螺内脏放入无菌离心管后经酚一氯仿法 抽提微生物DNA。使用获得的微生物DNA为模板,选择细菌原核通用引物F357一GC和R518进行PCR扩增得到大 ...
目前测定细菌群落结构的方法 主要包括:变性梯度凝胶电泳(DGGE/TGGE)、末端 限制性片段长度多态性分析技术(terminalrestric. tionfragmentlengthpolymorphism,T—RFLP)、建立 16SrDNA文库进行序列分析方法等。变形梯度凝 胶电泳(DGGE)方法在油藏微生物中的应用主要是 通过扩增得到总DNA中含有某一高变区的目的 DNA序列产物...
1、 基于16SrRNA基因高通量测序方法分析多花黄精内生细菌群落结构及多样性 蔡媛 刘浩 王勇庆 谢景 黄建华 劳嘉 贺炜 张水寒Summary 目的 采用高通量测序技术分析多花黄精内生细菌的多样性及菌群结构。方法 通过蒽酮-硫酸法测定多糖含量,采用通用引物对细菌16S rRNA高可变区(V3-V4区)进行PCR扩增,运用Illumina Miseq ...
本发明属于生物分析技术领域,具体为一种同时分析氨氧化或甲烷氧化相关细菌群落结构的分析方法。本发明步骤为:设计能同时覆盖颗粒性甲烷氧化酶α亚基基因和氨氧化单加氧酶α亚基基因的高简并加tag引物;利用此引物对环境样品中提取的基因组DNA进PCR扩增;利用barcode标记的tag引物对纯化过的第一步PCR产物进行PCR扩增;对...
本发明公开了一种花生不同生长时期根际土壤细菌群落结构的分析方法,通过收集花生不同生长时期的根际土壤,分别提取土壤基因组DNA,采用16SrRNA基因简并引物进行扩增,获得的PCR产物经均质化处理后纯化,用于构建16SrRNA基因文库,对得到的文库数据经分析比较,从而全面展示花生不同生长发育时期根际土壤的细菌群落结构。本发明...
细菌群落为了认识低基质浓度污水厌氧氨氧化(ANAMMOX)脱氮过程的生物学机制,为ANAMMOX脱氮工艺的优化提供理论依据,通过构建细菌16SrDNA(约1500bD)克隆文库和浮霉菌特有16SrDNA(约830bp)克隆文库对ANAMMOX脱氮反应器中活性污泥的细菌群落结构进行分析.从细菌16SrDNA克隆文库中随机挑选到160个克隆子,共31个分类单元(OTU),...
细菌群落为了认识低基质浓度污水厌氧氨氧化(ANAMMOX)脱氮过程的生物学机制,为ANAMMOX脱氮工艺的优化提供理论依据,通过构建细菌16SrDNA(约1500bD)克隆文库和浮霉菌特有16SrDNA(约830bp)克隆文库对ANAMMOX脱氮反应器中活性污泥的细菌群落结构进行分析.从细菌16SrDNA克隆文库中随机挑选到160个克隆子,共31个分类单元(OTU),...
细菌群落用于白酒酿造的酒曲被西方学者誉为中国的第五大发明[1],是白酒生产中微生物及酶的主要来源,不同的酒曲在微生物群落结构上存在差异,并直接影响酒的出酒率及酒质.因而,研究和鉴定白酒生产中与特征风味物质相关的关键微生物种类,对生产工艺改进具有重要意义.doi:CNKI:SUN:WSWT.0.2012-04-024金城《微生物学...
鲥鯸淀高通量测序Biolog-ECO浮游细菌附着细菌微生物群落为了解渔业环境中微生物群落特征对生态循环的影响,基于高通量测序与Biolog-ECO相结合的方法,探究白洋淀鲥鯸淀湿地浮游微生物和不同基质附着微生物的群落结构及其碳源利用能力.结果表明:鲥鯸淀湿地中优势菌群为疣微菌门Verrucomicrobia,变形菌门Proteobacteria,蓝细菌门...