其中包含的基因组数据涵盖人体肠道微生物中8个门的527个物种,包括179个尚未被报道的细菌新物种。与之前的CGR集合相比,新增了3个门和189个物种;与目前已发表的肠道微生物基因组数据集相比,CGR2提供了144个特有的物种,进一步填补了培养组领域数据与资源的空白。
我们提出了可培养基因组参考(CGR)数据集,从来自健康人的粪便样本中,培养出的大于 6,000种细菌,产生了1,520种非冗余、高质量的基因组草图。这1,520个基因组,可以覆盖人体肠道中主要细菌门和属,其中264个为新的参考基因组。我们发现,随着参考细菌基因组数量的增加,使宏基因组测序读数从50%提高到了> 70%,从而实...
我们的研究表明,参考细菌基因组数量的增加提高了映射元基因组测序读码率,从50%提高到70%,使人类肠道微生物组的描述更具分辨率。我们使用CGR基因组注释了338种细菌的功能,显示了这一资源在功能研究中的效用。我们还对38种重要的人类肠道物种进行了泛基因组分析,揭示了它们核心基因组和可有可无基因组之间功能富集的多...
在2017年6月12日在Nature Biotechnology发表的一篇论文中,DOE JGI的原核超级计划负责人Nikos Kyrpides及其研究人员报告说,发布了1,003种系统发育不同的细菌和古细菌参考基因组 - 迄今为止最大的版本。 该文的通讯作者Kyrpides说:“细菌和古细菌是地球上最多样性的自由生物体生物。 “他们已经征服了地球上的每一个环...
该研究通过整合鸡肠道微生物宏基因组数据,构建了迄今为止国际上最大的鸡肠道微生物参考基因组和基因集合。研究通过对功能基因的挖掘,阐释了鸡肠道微生物在碳水化合降解、细菌耐药等方面的特点,为鸡肠道微生物的研究提供了重要的基础数据和资源。 大量研究表明,肠道微生物与宿主的健康状态有着密切的联系。在家禽中,肠道...
细菌的基因组是指细菌染色体和染色体以外遗传物质所带基因的总称。(分值:1分)正确 错误 参考答案( )
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A、甲方法可将细菌的DNA切成小片段,然后分别克隆,建立基因组文库,A正确; B、乙方法为mRNA到DNA的过程,可建立cDNA文库,B正确; C、甲方法要以脱氧核苷酸为原料,C错误; D、乙方法需要逆转录酶参与,将RNA逆转录变成DNA,D正确。 故选C。 练习册系列答案 ...
大肠杆菌的基因组是一个双链DNA分子,其长度约为细菌细胞本身长度的: A 5倍 B 20倍 C 102倍 D 103倍 E 106倍 试题答案 在线课程 D 解析: A、B、C和E都不对;大肠杆菌本身长度约2000nm,其所含的DNA(基因组)分子量为2.6×109,由4×106核苷酸对组成。根据DNA双螺旋结构模型,每10个核苷酸对为3.4nm,可算...
(1)基因组文库中包含了一种生物的全部基因,因此步骤①中的成分X应为该细菌所有的DNA。质粒含有的氨苄青霉素抗性基因是标记基因,作用是鉴别受体细胞中是否含有目的基因,从而将含有目的基因的受体细胞筛选出来。 (2)观察可知,限制酶Sau3A I与BamH I的识别序列和切割位点虽然不同,但二者切割后得到的黏性末端相同,因此...