单细胞ATAC-seq是研究表观遗传学调控的利器,该技术经常被应用于疾病发生、细胞发育等方面。 Darren A C等人利用单细胞ATAC-seq技术绘制了雄性小鼠13个组织的染色质可及性图谱,发现了85类染色质可及性及约40万个潜在的调节元件,为了解哺乳动物的染色质可及性打下了基础。 首先根据单细胞的染色质可及性的异同将所...
单细胞ATAC测序（Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing，ATAC-seq）作为一把的“分子钥匙”，正逐步揭示细胞内部那深不可测的基因调控网络。LabEx可提供 scRNA-seq/scATAC-seq服务，对同一细胞进行全基因组表观基因组分析和转录组联合分析。一、单细胞ATAC测序是什么？单细胞ATAC测序，我们首先要...
SeekOne® DD 单细胞 ATAC + RNA多组学解决方案凭借其先进的技术，轻松实现了跨组织聚类的高度一致性。这种无缝整合的能力，让科研人员能够更全面地理解不同组织之间的细胞类型和基因调控网络的共性与差异，为多组织、多系统的综合研究提供了强大的工具。 3、分析破冰，轻松上手 SeekOne® DD 单细胞 ATAC + RN...
单细胞ATAC测序(Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing,ATAC-seq)作为一把的“分子钥匙”,正逐步揭示细胞内部那深不可测的基因调控网络。LabEx可提供 scRNA-seq/scATAC-seq服务,对同一细胞进行全基因组表观基因组分析和转录组联合分析。
单细胞转录组测序(scRNA-seq)是在单细胞水平上研究基因表达差异的技术,为细胞异质性研究提供了有力手段。而单细胞ATAC测序(scATAC-seq)是利用转座酶在单细胞水平上研究染色质开放性的技术,可以提供高分辨率的单细胞染色质开放图谱,有助于深入研究细胞异质性的表观遗传调控机理。它们的研究对象一个是mRNA,一个是染色...
在自然界,我们作为多细胞生物个体,身体里每一个不同的细胞都拥有同一套基因组信息,但最后都以不同的方式产生特异的转录图谱,从而表现出独特的生物学功能,这种细胞类型特异的转录被认为与染色质可及性相关。目前在对特定细胞类型染色质可及性的研究中,利用单细胞ATAC测序技术所获得的单细胞染色质可及性差异、细胞类...
这种转座酶可接近性染色质的研究方法(assay of transposase accessible chromatin, ATAC-seq)可以最少只利用大约500个细胞就可以快速的得到调控的多维信息,比其他方法要节省大约3到5个数量级的细胞。并且由于ATAC-seq的实验流程中没有片段选择的步骤,所以这种方法可以同时获得“开放”染色质的位置、转录因子的结合位点、...
单细胞ATAC的原理是先将组织解离成一个一个的单细胞,然后进行提核,然后进行细胞核分离后用TN5转座酶进行处理,转座酶回合染色质缠绕比较松的覅你官方发生转座反应,如果是同时得到转录组数据和ATAC数据,那么测到的转录组则是核里的mRNA。 https://www.jianshu.com/p/88826bd11ff6 2 软件安装与标准数据运行 1 首...
在自然界,我们作为多细胞生物个体,身体里每一个不同的细胞都拥有同一套基因组信息,但最后都以不同的方式产生特异的转录图谱,从而表现出独特的生物学功能,这种细胞类型特异的转录被认为与染色质可及性相关。目前在对特定细胞类型染色质可及性的研究中,利用单细胞ATAC测序技术所获得的单细胞染色质可及性差异、细胞类...
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