细胞-细胞相互作用(CCIs)是多细胞生命的基石,允许细胞在群落中存在并执行集体功能。细胞通过产生不同的分子和膜结构相互作用,激活其他细胞中的信号通路,协调基因表达,然后驱动细胞功能。这些相互作用包括结构蛋白和功能蛋白、小化合物、细胞外基质、膜突起和细胞外囊泡等。其中,与其他细胞上的同源受体结合的配体,...
细胞-细胞相互作用(CCIs)是多细胞生命的基石,允许细胞在群落中存在并执行集体功能。细胞通过产生不同的分子和膜结构相互作用,激活其他细胞中的信号通路,协调基因表达,然后驱动细胞功能。这些相互作用包括结构蛋白和功能蛋白、小化合物、细胞外基质、膜突起和细胞外囊泡等。其中,与其他细胞上的同源受体结合的配体,或配体...
推断细胞-细胞相互作用的计算工具的系统发育树 获得全单细胞分辨率的见解:最近的方法可以以真正的单细胞分辨率处理这些数据,推断出成对的单个细胞之间的通讯,如SoptSC、NICCHES、Scriabin、SPRUCE、DeepCOLOR等。 细胞空间背景化:查每个细胞空间背景的新 CCIs工具将更清晰地解读复杂组织中具有生物意义的通讯,如Giotto、Squ...
细胞相互作用分析流程主要包括以下几步:收集样本组织、制备单细胞悬液、建库和测序;对原始数据预处理获得基因表达矩阵;结合受配体数据库,保留矩阵中的配体或受体相关基因;对配体和受体之间的相互作用进行打分;可视化相互作用;对预测的配受体互作对进行验证。 细胞相互作用工具 目前,关于细胞相互作用分析的工具已经有很多,...
在多细胞个体中,组织形成,神经传递以及免疫响应等细胞间结合的生理过程中涉及细胞-细胞相互作用(CCIs, cell-cell interactions)。CCIs产生或传递的生理信号可通过膜表面蛋白以接触另一细胞表明受体的方式或者通过分泌化学信号的方式进行。在细胞间信号传递时,CCIs发生的过程高度动态、参与的组分也十分复杂。因此,解开CCIs中...
近年来,研究细胞与细胞相互作用(CCIs) 的工具经历了显著的多样化。 没有细胞生活在真空中,细胞之间的分子相互作用决定了大多数表型。 肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)由非恶性细胞组成,这些细胞相互作用并与癌细胞相互作用,深刻影响癌症的发生发展。其中微环境细胞类型之间的相互作用网络是分层的,主要是负反馈,...
1.细胞-细胞相互作用的接触依赖标记(图5) 接触依赖标记方法通常需要细胞表面的酶与邻近细胞膜表面的底物发生直接接触,随后通过酶催化激活生物素探针标记邻近细胞膜表面的受体底物上。这种标记方式基于酶与受体底物的物理接触,可保证较小范围的标记半径。 图5 基于酶与受体底物的直...
在多细胞个体中,组织形成,神经传递以及免疫响应等细胞间结合的生理过程中涉及细胞-细胞相互作用(CCIs, cell-cell interactions)。CCIs产生或传递的生理信号可通过膜表面蛋白以接触另一细胞表明受体的方式或者通过分泌化学信号的方式进行。在细胞间信号传递时,CCIs发生的过程高度动态、参与的组分也十分复杂。因此,解开CCIs中...
细胞-细胞相互作用:通过特定的相互作用,细胞可以相互影响表型。例如,免疫系统中的细胞可以通过细胞表面的配体-受体相互作用来增强或抑制免疫反应。细胞外基质:细胞外基质是细胞外的支持结构,由细胞分泌的蛋白质、多糖和其他物质组成。细胞外基质可以影响细胞的形态、分化、迁移和功能。例如,胶原蛋白组成的结构可以提供...
细胞间的相互作用-细胞间的相互作用细胞是生物体的基本单位,相互之间的相互作用是维持生命活动的重要因素。细胞间的相互作用可以通过细胞间的相互通讯、相互识别和相互影响等方式进行。这些相互作用对于维持生物体的稳态、组织的正常功能以及协调整个生物体的生理活动起着