QIIME2是一个综合的分析工具,它将是未来扩增子分析的绝对分析标准。 我们组学大讲堂提供的扩增子分析docker镜像(v1.4)使用的qiime2 版本为:Qiime2.2020.8版本。目前qiime2的最新版本为2022.8,相较于2020.8版本有很多大的更新,更新信息如下: 扩增子docker镜像更新说明 为使大家使用上最新的qiime2软件,我们也对我们的扩...
当我们加载一个镜像的时候,有可能环境中已经有同名,同版本号的镜像了,如果需要把新的镜像load上去,就需要对原有的镜像进行重命名(docker load 命令将从 tar 文件中加载镜像,并使用镜像在 tar 文件中的名称和标签),比如我们当前的环境中已经有一个镜像叫做reseq,版本号是v2.0: 那我们需要load进去一个新的镜像,...
2.下载镜像 docker pull docker.io/omicsclass/samtools:latest 运行镜像并使用samtools对t.fa文件建立索引 $ ll -rw-rw-r-- 1 biosoft biosoft 70 Mar 16 17:30 t.fa $ pwd /biosoft/docker/samtools $ docker run -v /biosoft/docker/samtools:/work --rm d505ac3f6c30 samtools faidx t.fa $ ll to...
我们组学大讲堂的服务器已经安装了singularity, 并且我们组学大讲堂提供的docker镜像都已经转换成sif文件，...
hub.docker.com和国内几家Docker Hub镜像服务平台陆续下架,停止服务。 给使用的同学造成非常大的困扰。 汇总了几种目前有效的解决方案,希望能帮助到大家,2024年8月30测试可用。 Docker镜像加速站设置(linux) sudo mkdir -p /etc/docker sudo tee /etc/docker/daemon.json <<EOF ...
可能有些基因没有转录本ID，你看看数据对应的行GFF是不是有异常；
k8s.gcr.io,gcr.io 是谷歌的镜像仓库,国内访问不了, quay.io 是 RedHat 的镜像仓库,可以访问,但速度较慢。 三.使用现成的镜像代理仓库下载镜像 3.1 使用阿里云镜像仓库 registry.aliyuncs.com/google_containers是定时同步kubernetes的镜像到阿里镜像仓库服务的,但只是K8S组件的镜像,阿里云镜像仓库有谷歌和RedHat的镜像...
镜像加载有问题建议重新下载镜像再次加载试试的；
看报错内容，“没有该文件夹”。 首先通过ll 查看一下文件夹是否存在
镜像下载使用方法 1)首先系统中docker安装与使用方法见课程: 2)镜像搜索、下载、启动使用方法: > docker search omicsclass #搜索组学大讲堂提供的所有镜像NAME DESCRIPTION STARS OFFICIAL AUTOMATEDomicsclass/gene-family gene-family analysis docker image 5 omicsclass/rnaseq RNA-seq analysis docker image build by...