注释结果表明,白魔芋线粒体基因组包含36个独特的蛋白编码基因,由24个核心基因和12个可变基因组成。核心基因包括5个ATP合成酶基因,1个细胞色素b基因,9个NADH脱氢酶基因,3个细胞色素c氧化酶基因,1个膜运输蛋白基因,1个成熟酶基因,4个细胞色素c合成基因。12个可变基因包括3个大的核糖体亚单位基因,8个核糖体小亚单...
从32种鲸类物种间和属内(真露脊鲸属、须鲸属、原海豚属和宽吻海豚属)线粒体基因组主编码基因(13个蛋白质编码基因和2个核糖体RNA基因)和D-loop区的变异位点分析显示,在鲸类群体遗传的研究中,nad5,nad4和nad2基因是理想的分子标记,可以作为cox1基因辅助的分子标记,用于分析鲸类不同群体之间的遗传多样性,为其...
鲸类线粒体基因组特征分析及分子标记探讨
采用引物步移法PCR扩增,获得全长为16846 bp 的河川沙塘鳢(Odontobutis potamophila)线粒体全基因组DNA (mtDNA),并对其基因结构,重排机制及在系统发育中的应用进行了分析.研究结果:(1)河川沙塘鳢mtDNA由37个基因和1个非编码控制区组成; 除 ND6和8个 tRNA 外,其他基因都编码在重链(H)上; tRNA 基因因发生滑移...
问题是你要比较纯的提出线粒体和叶绿体 排除nDNA的干扰 大多数标记都可以用~
中国是东亚蚌类(蚌目:蚌超科)物种分布中心,共记录有26属.然而,在世界蚌目框架下,中国仍缺乏一个完整科学的蚌类分类系统.本研究基于多位点分子标记(COI、16S、28S)和线粒体基因组学重构聚焦于蚌超科的蚌目系统发育关系,ML、BI和BEAST系统发育结果均支持蚌科5亚科分类系统,即(((Ambleminae+Gonideinae)+Recti...
分子标记为揭示南极磷虾(Eupahusia superba)(甲壳动物:软甲纲:磷虾目)线粒体基因组特征,及通过比较不同海域南极磷虾的线粒体基因组探讨潜在的分子标记,采用Long PCR扩增技术获得采自普里兹湾(Prydz Bay)南极磷虾线粒体基因组DNA,综合Primers-walking和Shotgun方法进行测序;通过生物信息学软件(DOGMA、tRNAscan-SE1.21...
线粒体基因组蛋白质编码基因基因重排分子标记系统发生棘皮动物棘皮动物(echinoderms)是海洋生境中所特有的无脊椎动物重要类群,本文全面比较分析了棘皮动物29个物种的线粒体全基因组.线粒体基因组主编码基因的分析结果显示,海胆纲Echinoidea和海参纲Holothuroidea物种的基因排列完全相同;海星纲Asteroidea物种之间的基因排列也...
线粒体基因组差异位点分子标记综合分析鲸类32个物种的线粒体基因组全序列,全面揭示了鲸类线粒体基因组的基本特征,蛋白质编码基因,选择压力和差异位点等.鲸类线粒体基因组均编码后生动物标准的37个基因.绝大多数鲸类线粒体基因组的基因排列顺序完全相同,而且与脊椎动物线粒体基因组的典型排列一致.4个类群(真露脊鲸属...
存在3个蛋白质编码基因(nad1,nad2和cob)的倒位.蛇尾纲蔓蛇尾目Euryalida的海盘Astrospartus mediterraneus,与真蛇尾目5个线粒体基因组相比,存在主编码基因的重排.棘皮动物线粒体单基因的变异位点特征显示,nad5,nad4和nad2基因是理想的分子标记基因.基于29个线粒体基因组的氨基酸序列,通过两种方法(邻接法和最大...