模拟红外光谱是通过计算机程序模拟红外光谱数据的过程。红外光谱是研究物质结构、成分以及化学键等方面的重要手段。模拟红外光谱可以帮助科学家们理解和解释实验观测到的红外光谱结果,进而对物质的性质进行分析和表征。 模拟红外光谱通常基于量子力学的密度泛函理论(DFT),通过计算物质的振动模式来预测其红外光谱。首先需要确定...
我们需要用Phonopy来模拟红外光谱和拉曼光谱。在这里我们需要用到一个名为Phonopy-Spectroscopy的包，Phonopy-Spectroscopy是一个在Phonopy中增加模拟振动光谱能力的包。这个软件包包括一个Python模块SpectroscoPy，以及一组用于处理Phonopy和VASP输出的命令行脚本。特点从Phonopy或VASP计算中计算红外（IR）强度；在远共振近似下...
模拟二维红外光谱是一个复杂的过程,简单来说,就是先通过一系列步骤获得体系中每个原子的电荷和速度,然后替换相关文件中的值,最后计算光谱。在这个过程中,有几点需要注意:一是计算光谱时没有进行均值零化、滤波、量子校正等处理;二是模拟时间长度决定光谱的分辨率,模拟时间越长,分辨率越高;三是模拟时间间隔决定光谱的...
α-SiO2:使用Phonopy接口模拟了α-SiO2(石英)的红外光谱和拉曼光谱,包括用Phono3py计算的第一原理线宽,并与RRUFF数据库的光谱进行了比较。
(一)引言:➢ 计算化学中一个很重要的内容就是各类谱图的模拟。红外光谱则是计算化学中最常见的可以模拟的光谱。本章内容以丙烯(C3H6)分子为例,介绍如何进行红外光谱的预测及谱峰如何指认。(二)计算过程:1. 模型建立 █ 软件版本Gaussian 16, GaussView 6 █ 使用方
我们需要用Phonopy来模拟红外光谱和拉曼光谱。在这里我们需要用到一个名为Phonopy-Spectroscopy的包,Phonopy-Spectroscopy是一个在Phonopy中增加模拟振动光谱能力的包。这个软件包包括一个Python模块SpectroscoPy,以及一组用于处理Phonopy和VASP输出的命令行脚本。
可以通过计算分子的振动频率、振动模式等来分析分子的红外光谱。这些结果可以与实验结果进行比较,以验证模型的准确性和可靠性。 总的来说,分子动力学模拟可以用来模拟红外光谱,这有助于深入了解分子的结构和性质,从而为实验研究提供理论支持。但需要注意的是,由于分子动力学模拟的计算量较大,因此需要进行合理的参数选择...
α-SiO2:使用Phonopy接口模拟了α-SiO2(石英)的红外光谱和拉曼光谱,包括用Phono3py计算的第一原理线宽,并与RRUFF数据库的光谱进行了比较。
化学中经常用红外光谱来分析溶液的组成和变化,因为某些分子基团有红外特征指纹。问题是,溶剂和溶质的峰常常叠在一起,分析起来甚是棘手。所以,我们可以借助于分子动力学模拟来模拟溶剂的红外光谱,以便帮助分析整个溶液的红外光谱。 要想计算一种物质的红外光谱,最简单的方法是用量子化学计算气相中的一个单分子。即通常用...
从Phonopy或VASP计算中计算红外(IR)强度; 在远共振近似下计算拉曼活度张量和标量平均强度; 准备峰值表,包括将模式分配给不可约表示(Phonopy接口); 输出可以自定义的模拟光谱,支持多单元系统和模拟仪器展宽; 包括来自Phono3py计算的第一原理模式线宽(Phonopy接口)。