紫花针茅主要存在于海拔4500-4800米的高寒草原地带，构成了一种特殊的草地生态系统，如紫花针茅草地、紫花针茅一小嵩草草地、紫花针茅+青藏苔草草地等，对畜牧业有显著影响，是藏系绵羊的重要放牧场所。在西藏南部的喜马拉雅山与冈底斯山之间的冰川洪积平原和山地，紫花针茅作为伴生种出现在以变色锦鸡儿为主...
在新疆，紫花针茅分布于天山南坡的亚高山、高山带和昆仑山、阿尔金山、帕米尔高山带的干旱阳坡、半阳坡、丘陵、平缓的高原剥蚀面、微凹的湖盆和宽坦的阶地。其伴生种有早熟禾 (Poa sp．