蛋白质的糖基化是蛋白质由糖基修饰的一种翻译后修饰,在多种生理和病理细胞功能中起着重要作用。糖蛋白质组学是研究蛋白质糖基化在整个蛋白质组层面的科学领域,利用液相色谱串联质谱(MS/MS)获取糖基化位点、糖基化水平和糖链结构的综合信息。然而,现有的糖蛋白质组学数据库搜索方法在确定糖链结构时常常面临挑战,因...
深入糖基化领域,糖蛋白质组学已成为蛋白质组学的一个专门子领域,专注于在蛋白质组水平上识别和表征糖基化事件。因此,临床糖蛋白质组学已成为糖蛋白质组学的一个子领域。在此,我们将糖蛋白质组学定义为将先进的糖蛋白质组技术与其他尖端技术相结合,分析临床样本,旨在寻找糖蛋白、糖肽、糖位点和糖链的异常表达。
此外,糖蛋白组学不断发展,有潜力完善男性生殖糖蛋白组,鉴定复杂的O-糖基化,并解决被认为是最严重的全球公共卫生问题之一的主要男性生殖挑战。考虑到已有大量报告表明精子中的许多糖蛋白对男性生殖至关重要,并已经进行了详尽的回顾,我们从组学角度更新了男性生殖系统的糖类和糖蛋白质谱及其与男性生殖障碍的关系。我们还...
使用专业的软件对LC - MS/MS等仪器产生的数据进行处理，比如识别糖肽段、确定糖基化位点、对糖蛋白进行...
这是目前糖蛋白组学研究中应用最为广泛的一种 N -糖蛋白鉴定方法。 肽:N -糖苷酶 F(peptide :N-gly-cosi-dase F , PN Gase F)几乎可以作用于所有的 N -糖链, 同时 使天冬酰胺转变为天冬氨酸, 造成相对分子质量增加 0.98, 从而起到质量标记 N -糖基化位点的作用。 这种方法应用十分方便, 但是不能区...
目前基云生物为客户提供的糖蛋白研究服务主要包括四个方面,第一,发生糖基化的蛋白质的鉴定;第二,糖基化位点的鉴定;第三,糖肽结构的解析;第四,糖基化对蛋白质功能的影响。如今,以实现糖蛋白高通量解析为目标的研究被称为“糖蛋白组学(glycoproteomics)”,它已经成为后蛋白质组学时代的重要科学研究领域。
糖蛋白质组学(glycoproteomics)是通过大规模分离、富集和鉴定糖蛋白,来分析特定生物样本中聚糖和糖基化蛋白的完整组库。糖蛋白质组学已逐渐成熟,这要归功于仪器、实验方法和计算搜索算法的进步。[1] 电子活化解离(Electron-activated dissociation,EAD)技术是一项突破性二级质谱裂解方式,其主要特点是碎裂速度快、效率高...
研究结果 RA和OA滑膜组织的蛋白质组学和N-糖蛋白组学分析 4名OA患者和4名RA患者的TMT的定量蛋白质组学和N-糖蛋白质组中共鉴定了7227种FDR蛋白质。OPLS-DA显示RA组和OA组样品可以很好地分离。比较分析发现RA中上调了427种蛋白质和...
糖蛋白的分离制备常采用离子交换层析凝胶过滤凝集素亲和层析等方法获得其中由几种不同类型凝集素亲合柱组成的序列凝集素亲合层析slac法是较好的方法糖组学糖蛋白糖链结构研究中随着研究技术的发展也有不经过糖蛋白提取纯化的步骤而以整个细胞为研究对象直接对其表面糖蛋白糖链进行相关结构研究的比如糖芯片法技术 糖组学...
近日,复旦大学化学系乔亮团队将深度学习与糖蛋白质组学相结合,开发了DeepGP深度学习框架。DeepGP在糖肽串联质谱(MS/MS)分析方面取得了突破性进展。相关成果以“Deep learning prediction of glycopeptide tandem mass spectra powers glycoproteomics”为题,在《Nature Machine Intelligence》上发表。