力匹配方法是Voth小组开发的一种多尺度粗粒化（multi-scale coarse graining，MS-CG）的方法，该方法的基本思路是：首先通过全原子经典力场对蛋白质体系进行MD模拟，通过模拟轨迹以及分析内部相互作用力数据，进一步拟合获得每个粗粒化位点之间的相互作用力参数，使粗粒化模型和全原子力场模型所得到的相互作用力有较好的匹...
粗粒化分子动力学CGMD,是一种基于分子动力学,为提升时间空间计算尺度而诞生的粗粒化算法,其核心思想是将全原子模型简化为粗粒化粒子模型,使用一个代表性珠子来代替数个原子,并使用粗粒化力场进行牛顿力学计算,可以显著降低计算成本,尽管会损失一定的原子级信息,但其在更大时间空间尺度上的计算预测效果较好。 目前CG...
系统不可粗粒化(图3d);给定一个 L,对于一个L*<L,有一定的简化有效性,则系统弱可粗粒化(图3e);给定一个L*,当L增长,即环境复杂度增长的时候,L*的有效性保持稳定,则系统强可粗粒化(图3f)。
吸附在固体表面时,这些蛋白质会发生变性或是与其他蛋白质团聚。 为了能研究更大的多蛋白质体系,将原子粗粒化以减少计算的颗粒数量是一种广泛使用的方法。粗粒化是计算化学家极其有用的工具。它使得无法在更短时间尺度上实际捕获的大分子体系的性质得以出现。 在目前已有的力场中,Martini粗粒化力场使用较为广泛。它...
粗粒化模型能模拟较大时间尺度的分子过程。对于生物大分子体系粗粒化模型优势明显。能在一定程度上反映蛋白质的折叠动态。研究脂质双分子层结构粗粒化模型有应用。粗粒化模型也用于高分子聚合物体系研究。有助于理解聚合物的链段运动特性。模型构建要平衡计算成本与模拟精度。多尺度粗粒化模型可连接不同尺度信息。粗粒...
1. Gibbs粗粒化： 定义：在统计力学中，Gibbs粗粒化是配分函数计算中关键的步骤，它基于系统在相空间中的分布密度。 理论依据：Gibbs粗粒化强调相空间中系统的相对数量而非绝对数量，通过粗粒化密度的定义，揭示了在系统总数趋向无穷时，相空间概率密度可以保持有限值。 与量子统计的关系：Gibb...
题目简述粗粒化方法除油的过程?相关知识点: 试题来源: 解析 先预处理去除杂质,当含油废水通过时,微小油珠便附聚在粗粒化滤料表面形成油膜,达到一定厚度后,在浮力和水流剪力作用下,脱离滤料表面,形成颗粒大的油珠浮上水面,用集油设备收集。反馈 收藏
粗粒化分子动力学作为分子模拟领域的重要方法，通过简化原子细节提升计算效率，在生物大分子体系和高分子材料研究中具有独特优势。力场开发作为该技术的核心环节，直接决定模拟结果的可靠性，其参数化过程需要平衡计算精度与效率的矛盾。近年来随着机器学习技术的渗透，多尺度力场构建方法展现出突破性进展。粗粒化模型的分类...
见著知微——微生物生态系统演化粗粒化模型，是一个基于资源竞争的生态演化模型，用于描述和模拟微生物生态系统的粗粒化现象。具体来说：模型构建：该模型是基于反应器中的微生物生态构建的，其中菌株以特定性状构成，资源按照一定速率供应并被竞争消耗。通过引入差异化相互作用，模型成功模拟了微生物生态系统...
该模型通过对原子进行分组构建粗粒化粒子。粗粒化过程依据分子结构和相互作用特征进行。不同类型分子有各自适宜的粗粒化策略。模型能有效减少系统自由度从而加快模拟速度。可通过映射关系实现原子尺度到粗粒化尺度转换。跨尺度模拟中需合理确定粗粒化粒子相互作用势。常用的相互作用势有Lennard - Jones势等(描述两粒子...