答案:①公式:等位基因频率=某基因的总数/种群中全部 等位基因的总数。基因型频率=某基因型个体数/种群个体 总数。 ②两者之间的关系: 种群中任何一对等位基因的频率之和等于1,各种基因型频 率之和也等于1。 一个等位基因的频率-该等位基因纯合子的频率+杂合子 的频率。 结果...
解析 P中 AA=A^2=0.64,A=0.8Aa=2A*a=0.32,a=0.2 即等位基因A的频率为0.8,a的频率为0.2亲本P产生的配子中A的频率为0.8,a的频率为0.2则F1中等位基因A 的频率为0.8,a的频率为0.2AA的频率为A^2=0.64,Aa频率为2*0.8*0.2=0.32,aa=0.04反馈 收藏 ...
等位基因频率计算公式 等位基因频率计算公式:基因频率=某基因的数目/全部等位基因的总数*100% 等位基因频率是群体遗传学的术语、一个种群中基因的多样性。等位基因频率是群体遗传学的术语,用来显示一个种群中基因的多样性,或者说是基因库的丰富程度。©2022 Baidu |由 百度智能云 提供计算服务 | 使用百度前必读 |...
本次程序运行计算了demo基因型文件中800个个体1000个SNP位点上的等位基因频率,并把结果储存在demo.afreq文件中,程序运行的信息记录在demo.log文件中。 查看demo.afreq文件,格式如下: 第一列为SNP位点的名称;第二列和第三列为该SNP位点上的两个等位基因a1、a2的形式;第四列为a1等位基因的频率。a2等位基因的频率...
计算等位基因频率有两种方式,第一种用vcftool计算: 1 /path/to/vcftools--vcffile.vcf --freq --chr 1 --out filefreq 很简单的一个命令行,file.vcf指的是你要输入的vcf文件,--freq表示计算等位基因频率,--chr后面的1表示你要计算的区域在1号染色体,当然,你也可以选择你想计算的染色体区域,filefreq指的...
解析A的频率=AA的频率+1/2Aa的频率=12%+1/2×76%=50% ,a的频率=aa的频率+1/2Aa的频率=12%=1/2×76%=50% 例1. 假设一对等位基因Aa的频率为A=0.9, a=0.1,那么AA、Aa、aa3种基因型的频率分别是多少? 例2. 一个群体中血型O、A、B基因的比例为6:3:1,若随机婚配,则表现为A、B、O和AB血型...
计算公式:当等位基因只有两个(设为A、a)时,设p表示A的基因频率,q表示a的基因频率,则:基因型AA的频率=p2;基因型Aa的频率=2pq;基因型aa的频率=q2;(p
计算等位基因频率 p<-list() n<-gt.list[[1]] %>% length() for(i in 1:length(gt.list)){ p[[i]] <- table(gt.list[[1]])/n } 自定义计算LD的函数 library(compiler) calcLD <- cmpfun(function(x,pa,ht,p){ n<-length(x) ...
从gds文件中计算次要等位基因频率可以通过以下步骤进行: 1. 首先,了解gds文件的格式和结构。GDS(Genetic Data Structure)是一种常用的存储基因组数据的文件格式,通常包含...
vcftools 计算等位基因频率使用VCFtools计算等位基因频率的方法如下: 1. 打开终端或命令提示符,进入包含VCF文件的目录。 2. 输入以下命令,将VCF文件作为输入: ``` vcftools --vcf input.vcf --freq --out output ``` 其中,`input.vcf`是包含VCF文件的文件名,`output`是输出文件的名称。 3. 运行命令后,...