但是用于展示突变的瀑布图和传统的瀑布图并不完全一样,不过他们的展现形式很像。 SNP的瀑布图 在SNP的瀑布图中,横轴表示的是不同的样本,纵轴是基因,填充则代表该基因发生突变,不同的颜色代表不同的突变情况。上面的柱状图是对于每个样本突变情况的统计。 所以从该图我们既能够获得每个样本的具体信息,也能够从全局了...
# 使用oncoplot函数绘制基因突变瀑布图 # oncoplot for top ten mutated genes. # 展示top20变异基因的信息 oncoplot(maf = laml, top = 20) # 侧面条形图和顶部条形图可分别由drawRowBar和drawColBar参数(默认为TRUE)控制。变异注释为Multi_Hit表示同一样本中突变多次的基因 maftools-1 2.3 其他参数设置 # ...
所以从该图我们既能够获得每个样本的具体信息,也能够从全局了解这一组样本的整体情况,很好地展示了突变的情况。 怎么做瀑布图 本次作图我们使用一个叫做GenVisR的R包,该包除了提供瀑布图还提供了多种其他形式较为复杂的、用于展现多个样本突变情况的数据图(见下图),具体的作图方法大家可以参考GenVisR使用手册。 Gen...
SNP的瀑布图 在SNP的瀑布图中,横轴表示的是不同的样本,纵轴是基因,填充则代表该基因发生突变,不同的颜色代表不同的突变情况。上面的柱状图是对于每个样本突变情况的统计。 所以从该图我们既能够获得每个样本的具体信息,也能够从全局了解这一组样本的整体情况,很好地展示了突变的情况。
所以从该图我们既能够获得每个样本的具体信息,也能够从全局了解这一组样本的整体情况,很好地展示了突变的情况。 怎么做瀑布图 本次作图我们使用一个叫做GenVisR的R包,该包除了提供瀑布图还提供了多种其他形式较为复杂的、用于展现多个样本突变情况的数据图(见下图),具体的作图方法大家可以参考GenVisR使用手册。 Gen...
传统瀑布图的例子 可以看到该例子展示了获利能力的分析。但是用于展示突变的瀑布图和传统的瀑布图并不完全一样,不过他们的展现形式很像。 SNP的瀑布图 在SNP的瀑布图中,横轴表示的是不同的样本,纵轴是基因,填充则代表该基因发生突变,不同的颜色代表不同的突变情况。上面的柱状图是对于每个样本突变情况的统计。