主要技术:空间转录组学、空间代谢组、代谢异质性 导语 单细胞转录组可以为大脑不同细胞类型的无偏移样本定量,提供分子特征;但在验证和整合结果方面,还不能满足空间组织和功能定位方面的要求,也缺乏代谢信息,而空间转录组(ST)可以解决这一问题。在该文章当中,利用6名脑外伤患者术后样本进行空间转录组和空间代谢组联...
空间多组学技术能够解析转录组、代谢组、蛋白质组或表观遗传组水平上的空间分子谱。空间转录组学能够测量mRNA的表达,而基质辅助激光解吸电离质谱成像(MALDI-MSI)则能够在组织切片的特定光栅点处收集质荷比(m/z)光谱。将空间转录组学和MALDI-MSI相结合以生成多模块空间数据,能够更全面地理解和洞察切片点的生物状态。
这些结果表明,oCRC中的FDPS+恶性细胞具有非常活跃的代谢,肌成纤维细胞可以为这些癌症细胞提供谷氨酰胺以进行谷氨酰胺代谢。 总结 本研究通过综合单细胞测序、空间转录组学的测序分析,发现了一个以PTPRO和ASCL2为特征的肿瘤干样细胞群是CRC转移的驱动者,亚群进一步细分和鉴定后,发现不同的异质干样细胞亚群显示出不同...
空间转录组学是一种研究细胞或组织内基因表达的技术,它能够揭示细胞内基因的转录活动和调控机制。而空间代谢组学则是研究生物体内代谢产物的技术,能够揭示代谢途径和代谢产物之间的相互关系。将这两种技术结合起来,可以更全面地了解细胞内基因表达和代谢调控的关系,有助于揭示疾病发生机制和药物作用方式。 在疾病诊断方面...
空间转录组 空间代谢组 脂质组学 空间转录组、空间代谢组和脂质组学是生物学和生物医学领域中的重要研究方向,它们在研究生物体在不同空间条件下的基因表达、代谢组成和脂质分布等方面具有重要意义。 首先,空间转录组研究关注在不同的空间条件下,生物体的基因表达情况。由于在太空或其他特殊空间环境中,生物体会受到辐射...
质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析,结合生物信息学分析,发展为空间代谢组学方法,可从生物组织原位发现差异代谢物,并识别其生物学功能。 · 空间代谢组学 鹿明空间代谢组是基于质谱成像技术发展而来的,免标记、无需基质、周期短。通过质谱成像技术对不同组织器官中的代谢物进行定性、定量...
与空间转录组同概念的下一个技术浪潮——空间代谢组学 质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)作为一种新型的分子影像技术,能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源性药物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法(如荧光成像、放射性标记成像等),该技术无需化学或放射性...
ε=(´ο`*)))唉!那不得不探讨这么一个问题为什么要进行空间代谢组研究? 代谢组学的研究目标是尽可能对生物系统中所有代谢物进行定性和定量的分析,是研究代谢物谱、代谢表型、代谢变化、代谢途径和发现生物标志物强大的分析工具。色谱-质谱联用技术整合了色谱的高效分离能力和质谱的强大分析功能,具有灵敏度高、选...
这就意味着它们内部的代谢物分布是不一样的。中心部分可能糖分更多一些,像是住在这里的“小居民”都喜欢储存“甜食”;而表皮部分可能含有更多的保护类物质,就像是住在边境的“守卫”,得把自己武装起来,防止外界的侵害。 通过这次菜市场买菜和做菜的体验,我算是对空间转录组和空间代谢组中代谢物的空间分布特征有了一...
带来以单细胞、空间转录组、空间代谢组 技术为核心的精彩主题报告。图 | 时空多组学会议主持人吕海涛研究员 # 02 沙龙面对面环节，6位专家老师，聚焦时空组学探究12大热点问题！现场进行充分交流，聚焦研究领域，深层次探讨创新时空多组学技术应用问题。精彩的讨论也是本场大会的亮点~~（现场专家从左到右依次为：上海...