稀释曲线(Rarefaction Curve,也称稀疏曲线):一般在微生物组研究中用于评估测序量或样本量的饱和情况。稀释曲线通过从每个样本中随机抽取一定数量的序列(即在不超过现有样本测序量的某个深度下进行重新抽样),可以预测在一系列给定的测序深度下,所可能包含的物种总数及其中每个物种的相对丰度。因此,通过绘制稀释曲线,还可以...
稀释曲线(Rarefaction curves)类似于物种累计曲线(Species accumulation curves),是微生物群落多样性分析流程中的关键一环,其是从大样本中随机抽取一定量的测序序列数据,且以抽取的序列数量和注释所得的代表性物种ASVs/ASVs数量构建曲线。由下例图Observed ASVs Curves(Richness Index Curves)所示,横坐标代表随机抽取的序列...
稀释曲线的原理基于比尔-朗伯定律(Beer-Lambert Law),该定律指出,在特定波长下,溶液的吸光度与溶液中溶质的浓度成正比。因此,通过测量不同稀释步骤中溶液的吸光度,可以绘制出吸光度与溶液浓度之间的关系曲线,即稀释曲线。 以下是使用稀释曲线确定溶液浓度的基本步骤: 1.准备一系列已知浓度的标准溶液,通常包括几个不同...
解析 分析:图1,碱性溶液稀释时,由于碱性溶液的pH>7,而水的pH=7,随着加入水的质量增加,pH不断减小,但不会小于等于7。 图2,酸性溶液稀释时,由于酸性溶液的pH<7,而水的pH=7,随着加入水的质量增加,pH不断增大,但不会大于等于7。反馈 收藏
某湿地修复工程监测数据显示,修复区域稀释曲线达到平台所需的采样量比退化区减少35%,同时等级丰度曲线斜率降低28%,表明生物多样性恢复且群落结构趋于复杂。实际操作中需注意,高通量测序产生的稀释曲线可能因PCR扩增偏差影响准确性,建议配合Chao1等估算器校正;等级丰度曲线解释时应结合具体分类单元,如变形菌门的高丰度在不...
原神攻击力稀释曲线 一,介绍 1.稀释是一种自然行为,只要你堆叠一个加算值。 2.稀释的基本原理是,在增加相同值的基础上,不同的增加率被称为稀释。 3.举例: 当你有100点攻击力时,得到200点攻击力加成两次。 第一次获得200点攻击时,升级为(120/100)-100%=20% ...
稀释曲线(Rarefaction Curve,也称稀疏曲线):一般在微生物组研究中用于评估测序量或样本量的饱和情况。稀释曲线通过从每个样本中随机抽取一定数量的序列(即在不超过现有样本测序量的某个深度下进行重新抽样),可以预测在一系列给定的测序深度下,所可能包含的物种总数及其中每个物种的相对丰度。因此,通过绘制稀释曲线,还可以...
稀释曲线(Rarefaction curves)是从样品中随机抽取一定测序量的数据(序列条数),统计它们所对应的OTUs(operational taxonomic units,可操作分类单元)种类(代表物种),并以抽取的测序数据量与对应的代表OTUs来构建曲线。一般情况下,横坐标代表随机抽取的序列数量,纵标代表观测到的OTUs种类数量,样本曲线的延伸终点的横坐标位置...
alpha多样性指数的大小是与使用的ASV/OTU表的抽平深度有关,为探究样本alpha多样性随抽平深度的变化曲线,可绘制稀释曲线(rarefaction curve),这是生态领域的一种常用方法。 稀释曲线通过从每个样本中随机抽取一定数量的序列(即在不超过现有样本测序量的某个深度下进行重新抽样),可以预测在一系列给定的测序深度下,所可能...
生成稀释曲线的核心思路是“随机抽样”。假设现有测序数据代表样本的全部微生物组成,通过多次随机减少测序数据量(比如每次减少10%),计算每次抽样后的物种多样性指数(如ObservedSpecies或Shannon指数),将这些数值连接成线,形成曲线。当曲线趋于平缓时,说明当前测序深度已足够覆盖样本中大多数物种。 生成步骤 打开QIIME1工作...