2023年5月9日,华中科技大学生命学院薛宇教授团队在国际著名期刊Nucleic Acids Research发表题为“GPS 6.0: an updated server for prediction of kinase-specific phosphorylation sites in proteins”的论文,提供了一款可以方便简单地预测激酶特异性磷酸化位点,并对结果做出注释的在线工具(1)。(拓展阅读:薛宇课题组相关研...
该工具使用来自真核磷酸化位点数据库EPSD的实验鉴定磷酸化位点以及来自GPS 5.0、Phosphositeplus和PubMed文献中的ssKSRs，构建了577个预测器用于预测不同激酶的特异性磷酸化位点，并整合22个公共数据资源对预测结果进行注释。自2004年起，薛宇团队开发了一系列GPS算法用于预测激酶特异性磷酸化位点。2020年，...
蛋白质翻译后修饰磷酸化位点预测工具 —— GPS 2.0 GPS 2.0, a Tool to Predict Kinase-specific Phosphorylation Sites in Hierarchy Yu Xue , Jian Ren , Xinjiao Gao, Changjiang Jin, Longping Wen, and Xuebiao Yao Mol Cell Proteomics.2008 ; 7: 1598-1608 [Abstract] [Full Text] [Supplemental Da...
在左侧激酶家族树中选择激酶种类，把需要预测的蛋白质序列填到输入框中点submit即可，如果一次输入多条序列需要使用FASTA格式。软件安装包中有用户手册。
摘要 本发明涉及一种利用整合工具预测水稻蛋白质磷酸化位点的方法,其特征在于:以在试验中检测到的水稻蛋白质磷酸化位点数据为训练集,以n种蛋白质磷酸化位点预测工具为子工具,通过一定的权重策略,为各子工具分配权重,将n种子工具整合成水稻蛋白质磷酸化位点预测的整合工具,通过所述整合工具预测水稻蛋白质磷酸化位点。其...
GPS3.0磷酸化位点预测软件 预测蛋白质的PTM修饰位点 常见蛋白质的棕榈酰化修饰位点预测.doc 总结来说,CSS-Palm、NBA-Palm、WAP-Palm、SEQ-Palm和MDD-Plam是预测蛋白质棕榈酰化位点的有力工具,它们分别利用不同的算法和特征提取方法,为研究者提供了预测蛋白质翻译后修饰的重要手段。通过对这些软件的运用和... 蛋...