1、测序通量：长读长技术的测序通量明显低于短读长技术，而短读长技术有更高的测序通量，能够更全面地检测基因组的变异和结构变化。2、错误率：长读长技术的错误率高于短读长技术，而短读长技术通过使用特殊的文库制备方法和仪器，可以降低错误率，提高检测的准确性。3、对RNA文库的质量要求：长读长技...
总体而言,通过109个样本的混合测序获得了4497个MAG,短读长测序获得了2789个MAG。 研究发现,在混合测序中加入长读长测序数据,可以显著改善基因组组装的连续性,混合测序的平均N50为339kbp,使用短读长测序的N50为12kbp,获得了基于MIMAG...
1. 与BGI测序相比,ONT测序在ARG宿主鉴定方面表现的更好 与BGI测序相比,ONT测序鉴定出更多的ARGs-宿主联系(图1a)。ONT测序检测到6个科的宿主家族和68种ARGs,而BGI测序仅检测到肠杆菌科和假单胞菌科作为24种ARGs的宿主家族(图1b)。 图1 ARG宿主鉴定的长、短读长测序比较 2. 与ONT测序相比,EpicPCR检测到更多...
1. 与BGI测序相比,ONT测序在ARG宿主鉴定方面表现的更好 与BGI测序相比,ONT测序鉴定出更多的ARGs-宿主联系(图1a)。ONT测序检测到6个科的宿主家族和68种ARGs,而BGI测序仅检测到肠杆菌科和假单胞菌科作为24种ARGs的宿主家族(图1b)。 图1 ARG宿主鉴定的长、短读长测序比较 2. 与ONT测序相比,EpicPCR检测到更多...
研究人员利用混合测序(短读长和长读长测序)和Hi-C技术,对三个人群(华人、马来人和印度人)的109个肠道微生物组进行了深入表征,全面重建了4497个中等和高质量的宏基因组组装基因组(MAG)。 文章发表在Nature Communications上 特定人群高质量肠道微生物参考目录的生成...
这一高性能、长读长的人类全基因组测序(WGS)分析方法,兼容因美纳NovaSeq TM X Plus、NovaSeq TM X和NovaSeq TM 6000测序系统。该技术首次支持用户在同一台因美纳测序平台上获取长读长和短读长数据。相较其他长读长技术,Illumina Complete Long Reads提供了更简单的工作流程,并且降低了DNA起始量的要求。
Illumina Complete Long Read Prep, Human,这一高性能、长读长的人类全基因组测序(WGS)分析方法,兼容因美纳NovaSeqTM X Plus、NovaSeqTM X和NovaSeqTM 6000测序系统。该技术首次支持用户在同一台因美纳测序平台上获取长读长和短读长数据。相较其他长读长技术,Illumina Complete Long Reads提供了更简单的工作流程,...
Illumina Complete Long Read Prep结合了因美纳独特的边合成边测序(SBS)技术和DRAGEN二级分析,生成了高准确度的全基因组测序(WGS)数据。此外,这款产品的价格已经包含了短读长和长读长文库制备、测序以及云分析的全部费用,为用户提供了极大的便利。 因美纳的首席技术官兼研究与产品开发负责人Alex Aravanis表示,与传统的...
如果是全基因组测序,还有检测结构变异 SV,常用的软件有 DELLY 、Lumpy 、Manta 、Pindel 和 SVMerge ,但由于二代测序的 reads 读长较短,检测 SV 仍然存在挑战性。拷贝数变异和 SV 可以通过 IGV 进行可视化查看: 生信菜鸟团 2021/09/17 1.5K0 文献解读-遗传病-第四期|《来自印度的自称健康个体的 1029 个...
Illumina Complete Long Read Prep, Human,这一高性能、长读长的人类全基因组测序(WGS)分析方法,兼容因美纳NovaSeqTM X Plus、NovaSeqTM X和NovaSeqTM 6000测序系统。该技术首次支持用户在同一台因美纳测序平台上获取长读长和短读长数据。相较其他长读长技术,Illumina Complete Long Reads提供了更简单的工作流程,...