作为使用该图谱的第一个例子,研究团队分析了具有已知免疫功能的免疫细胞类型和蛋白质,得出了细胞因子产生的空间和细胞图谱。该蛋白质组图谱为皮肤蛋白的定量分布和相互关系提供了综合性的表征。因此,这一蛋白组学图谱是未来系统研究人类皮肤生物学和病理学的宝贵资源。 研究结果 深入的人类皮肤蛋白质组学图谱:为了创建...
为了讨论不同分层皮肤组织的功能特征，研究人员利用DDA数据及进行了深入分析。首先，他们分析了表皮中的47种皮肤角蛋白(KRTs)、使外层肌肤具有机械稳定性的谷氨酰胺转胺酶以及真皮中提供结构支架和弹性的相关糖蛋白，蛋白组学数据证实了这些蛋白质在皮肤中处于执行这些功能的良好位置。除了结构上的作用外，皮肤同时扮演着...
2020年11月，哥本哈根大学诺和诺德基金会蛋白质研究中心的科学团队在Nature Communnications期刊发表的题为“Spatially and cell-type resolved quantitative proteomic atlas of healthy human skin”的文章，该研究利用4D-DIA蛋白组学平台，结合先进的采样策略，首次成功绘制健康人皮肤的蛋白质组学图谱，为研究人类皮肤的生...
该研究利用空间蛋白质组学(Spatial proteomics)鉴定了JAK抑制剂(JAKi)可作为一种致命皮肤病——中毒性表皮坏死松解症(Toxic epidermal necrolysis,TEN)的治疗方法,并在TEN患者中验证了JAKi的安全性,而且能过迅速促进患者皮肤表皮的再生和恢复...
为此,中国医学科学院北京协和医院冷泠/李军团队与国家蛋白质科学中心 (北京) 马洁/朱云平团队利用空间定量蛋白质组学结合脱细胞、MMI激光捕获显微切割和质谱法构建了一个分层皮肤蛋白质组图谱。 人类皮肤由分层鳞状上皮和含有各种基质细胞及细胞外基质(ECM)的真皮组成。基底膜(BM)是位于真皮顶部的一层薄膜,通过传递物理...
人体皮肤分层的空间功能特征 为了确定划分不同关键特征的边界及其生物学意义,进行了层次聚类分析(HCA)和基因本体论(GO)分析,确定了六个蛋白质模块,表征具有不同功能的皮肤层(图2a)。模块1代表六层中SC中含量最高的蛋白,它们参与衰老的各个方面,如角质化、角化、脂质代谢、蛋白水解和程序性细胞坏死。模块2和3分别代...
皮肤鳞状细胞癌是一种来源于皮肤表皮鳞状细胞的恶性肿瘤,其发病机制涉及基因表达的异常和蛋白质组成的改变。转录组学和蛋白组学是研究肿瘤发生发展的重要手段,对于揭示皮肤鳞状细胞癌的发病机制和发现新的治疗靶点具有重要意义。 2.皮肤鳞状细胞癌的转录组学研究 基因表达谱分析:近年来,利用高通量测序技术对皮肤鳞状细胞...
图2.不同皮肤层和细胞类型中蛋白的数量和PCA。来源:Nature Communnications 免疫活性蛋白的检测和分析 为了确定皮肤免疫保护作用下的蛋白质,研究人员量化了大量具有促炎和抗菌活性的蛋白质,蛋白质组学数据也显示了广泛的免疫活性蛋白的存在。同时,研究发现,不同皮肤层免疫相关蛋白质的表达有令人难以置信的数量和空间差...
近日,世界著名蛋白质组学专家Matthias Mann教授团队将其最新的研究成果发表在了国际学术期刊Nat Commun (IF=12.121) 杂志上。研究者通过分离皮肤不同空间结构的组织和组成皮肤的不同细胞类型,利用蛋白质组学的手段对高深度皮肤组织空间和不同...
“这种空间蛋白质组学方法揭示了患者体内炎症性JAK/STAT通路的超活化现场,这是我们以前不知道的,”研究人员谈道。“这些发现对今后了解、预防和治疗此类皮肤病具有深远的意义。” 另一方面,研究人员从中毒性表皮坏死患者体内分离出角质形成细胞,在体外用一种名为tofacitinib(托法替尼)的JAK抑制剂处理后,细胞毒性特征得...