“兰州百合基因组中的长基因非常常见。”宁国贵说，其平均长度为57.61 Kb。而长度超过50 Kb的基因被定义为“超长基因”，占33.88%。“然而兰州百合基因编码序列的平均长度仅为847.17 bp，提示我们其长内含子才是形成超长基因的主要原因。”宁国贵说，百合基因的平均内含子长度约为19.13 Kb，在所有已发表的植物...
兰州百合基因组中,重复序列占比高达88.31%,其中长末端重复反转录转座子(LTR-RTs)占64.40%。分析显示,兰州百合的LTR-RT在近五百万年以来发生急剧扩张,其中Copia类的扩张约一百六十五万年前达到高峰,Gypsy类的扩张则在约八十九万年前爆发;在更细分的亚类型层面,Athila...
近日,浙江大学园艺学院于 Nature Communications期刊发表题为“The giant genome of lily provides insights into the hybridization of cultivated lilies”的研究论文,该研究提供了泸定百合( 35.66 b)和嘉兰百合( 5.09 Gb)的参考基因组,对百合的进化、蔗糖和淀粉基因家族的扩张、关键发育基因的识别及秋水仙碱在中...
兰州百合基因组中,重复序列占比高达88.31%,其中长末端重复反转录转座子(LTR-RTs)占64.40%。分析显示,兰州百合的LTR-RT在近五百万年以来发生急剧扩张,其中Copia类的扩张约一百六十五万年前达到高峰,Gypsy类的扩张则在约八十九万年前爆发;在更细分的亚类型层面,Athila、Retand、Tekay和Tork等亚类获得了特异性的快速...
reveals a novel multichromosome structure”的研究性论文,系统分析了青岛百合(Lilium tsingtauense) 的完整线粒体基因组,并揭示了其独特的多染色体结构。通过结合BGI短读和Nanopore长读测序技术,研究人员完成了青岛百合第一个完整的线粒体基因组的测序、组装和注释,并进行了广泛的比较分析。贝纳...
基因组荧光原位杂交技术崭露头角，其原理是利用标记外源染色体或基因组特异 DNA 片段为探针，与待检样本染色体原位杂交；荧光标记下，杂交信号精准定位染色体位点，直观呈现遗传物质组成。在小麦、水稻等作物染色体工程成果斐然，却鲜用于百合。百合染色体数目多、形态相近，传统核型分析难精准鉴别，GISH 有望破局，为百合...
1. 超大基因组的染色体水平组装 流式细胞实验和K-mer分析预估兰州百合基因组的预估大小分别为38.01 Gb和37.62 Gb,杂合率为2.18%。细胞核型分析显示其为二倍体,具有12对巨型染色体。结合Nanopore、Illumina和Hi-C数据,成功组装得到36.68 Gb的基因组,Scaffold N50为2.86 Gb,96.99%的序列被挂载到12条染色体上(图1A)。
2024年10月24日,南京农业大学滕年军教授团队联合国内10多家科研机构,正式公布了迄今世界上最大的植物基因组——兰州百合基因组,基因组大小达到36.68 Gb。这一杰出成果不仅在植物基因组学领域具有里程碑式的意义,也为理解植物的生物学特性和进化历程提供了重要依据。
南农合作发布兰州百合基因组 本报讯 10 月 24 日,我校园艺学院滕年军教授团队、薛佳宇副教授团队, 华中农业大学园艺林学学院宁国贵教授团队与福建农林大学明瑞光教授团队等国内 10 多家科研团队联合公布了百合高质量染色体级别基因组, 成为世界上首个正式报道的最大植物基因组。 相关文章“The evolutionary tale of...
重楼百合有着世界上最庞大的基因组，基因组中拥有大约1500亿个碱基对，差不多是人类的50倍（人类基因组有31.6亿个碱基对），这意味着，重楼百合每个细胞中的DNA双螺旋连接起来，将达到90米，你很难想象如此小的细胞中，居然能塞下90米长的DNA。重楼百合之所以具有如此多的基因组，和它是异源八倍体有关，基因...