CancerSCEM数据库收集了涵盖人类20种癌症类型、总计208个癌症样本的单细胞RNA-seq数据,使得我们可以比较不同癌症类型之间的细胞成分和许多功能分子的表达,最终挖掘出一些新的优越免疫检查点,可用于未来针对特定类型癌症的临床免疫治疗。(https://ngdc.cncb.ac.cn/cancer...
该模块显示miRNA-靶基因在某个癌症多个样本中的表达量。 1、输入miRNA名称或miRBase ID。 2、输入靶基因(编码蛋白或非编码RNA)。 3、与目的miRNA关联的癌症,点击癌症名称右侧即可显示miRNA-靶基因在某个癌症多个样本中的表达量。 4、选择研究的癌症,下方即可显示miRNA-靶基因在某个癌症多个样本中的表达量。 右...
数据类型:RData 变量名称:expDataTPM > ##加载数据,数据对象是一个数据框,变量名称是:expDataTPM> load("processedTCGAdata/TCGA-RNASeq-TPM/TCGA-ACC_RNASeq_TPM.RData")> head(expDataTPM)[,1:3]TCGA-OR-A5JJ-01A-11R-A29S-07 TCGA-OR-A5LT-01A-11R-A29S-07 TCGA-OR-A5LH-01A-11R-A29S...
CancerSCEM数据库收集了涵盖人类20种癌症类型、总计208个癌症样本的单细胞RNA-seq数据,使得我们可以比较不同癌症类型之间的细胞成分和许多功能分子的表达,最终挖掘出一些新的优越免疫检查点,可用于未来针对特定类型癌症的临床免疫治疗。(https://ngdc.cncb.ac.cn/cancerscem/index) lBrowe 单击导航栏中的“Project Bro...
该模块通过分析TCGA数据库整合的32种癌症类型(约10000 RNA-seq和约9900 miRNA-seq样本)的表达图谱,提供lncRNA、miRNA、假基因、snoRNA、RNA结合蛋白(RBP)和所有蛋白质编码基因的泛癌症网络。共有6个子模块,接下来小编以miRNA相关的模块为例介绍Pan-Cancer的使用方法。