新华网北京5月31日电(记者 吴晶晶)由来自中国、美国、荷兰、以色列等14个国家的300多位科学家组成的“番茄基因组研究国际协作组”经过8年多努力,完成了对栽培番茄全基因组的精细序列分析。这项成果31日以封面文章形式发表在国际权威学术期刊《自然》上。 番茄是研究果实发育的经典模式植物,其基因组有12条染色体。协...
番茄作为世界上消费最多的蔬菜之一,由于遗传多样性较低从而限制了其改良的潜力。近期一项番茄参考基因组序列的公布,极大地促进了这一重要作物的科学发现和分子育种。基于725份具有系统发育和地理代表性的样本的基因组序列构建了一个番茄全基因组文库,揭示了参考基因组中缺失的4873个基因。存在/缺失变异分析表明,在番茄驯...
番茄LBD基因家族的全基因组序列鉴定及其进化分析一、引言番茄(Solanumlycopersicum)作为研究植物生长发育和遗传改良的重要模式植物,其基因组中的基因家族研究对于揭示植物进化机制和基因功能具有重要意义。LBD(LATERALORGANBOUNDARIES)基因家族是一类在植物侧生器官边界形成和侧生生长中起关键作用的转录因子。本研究旨在对番茄LBD...
因此,本研究通过生物信息学方法在全基因组水平上鉴定番茄BURP基因,分析其理化性质、基因结构、共线性、启动子元件等,并结合RT-qPCR验证其在果实发育以及盐胁迫、喷施植物生长调节剂后果实中的表达模式,为深入解析番茄BURP基因家族在抗逆、果实发育及对外源植物生...
1. 行商番茄 行商番茄是一种广泛种植的番茄品种,被广泛用于遗传学和基因组学研究,已经有成熟的基因组测序数据可供参考。 2. 樱桃番茄 樱桃番茄是一种小型的番茄品种,不仅具有良好的口感,而且是一种很好的模式植物,在番茄的分子遗传学和基因组学研究中经常被使用。 3. 豆腐番茄 豆腐番茄是一种大果...
进一步研究发现,番茄耐盐性的增强归因于活性氧清除能力的提高、Na+毒性的降低以及渗透胁迫效应的减弱。此外,还利用转录组和翻译组联合分析方法,对开放阅读框进行了全基因组分析,为进一步研究番茄中的uORF奠定了基础。总之,该研究结果为在盐胁迫背景下通过基于uORF的策略和翻译调控增强遗传性状提供了新的视角和重要数据。
本报北京5月31日电(记者胡其峰)由来自中国、美国、荷兰、以色列等14个国家的300多位科学家组成的“番茄基因组研究国际协作组”,历时8年多的艰苦努力,于近日完成了对栽培番茄全基因组的精细序列分析。今天,国际权威学术期刊《自然》以封面文章发表了这项重大科学成果。
番茄褪绿病毒感染和非生物胁迫条件对植物生长和产量构成威胁,而 DCL、AGO 和 RDR 基因家族在这一过程中可能发挥关键作用。材料与方法本研究采用多毛番茄全基因组数据库,通过比对和注释,鉴定了 DCL、AGO 和 RDR基因家族成员。利用生物信息学方法分析这些基因在不同组织和病毒感染、非生物胁迫条件下的表达模式。进而...
作为解析复杂性状的有效的基因定位方法,全基因组关联研究(GWAS)允许在非结构化种群(例如种质和育种系的集合)中识别具有密集基因组覆盖的标记和 QTL 之间的紧密联系。这些GWAS 技术具有更高的重组率,以提高相对于双亲种群的映射分辨率。此外,可以在这些群体中探索感兴趣性状的不同等位基因。全基因组单核苷酸多态性(SNP...
日前,深圳农业基因组研究所(以下简称"基因所")的最新研究成果,在线发表于权威学术期刊《NatureGenetics(自然遗传学)》杂志上。基因所通过对360份番茄种质全基因组的分析,阐明了番茄驯化和育种的基因组学历史,为番茄生物学研究提供了新的工具,奠定了番茄全基因组设计育种的基础。这项研究是我国在番茄研究方面继2012年完...