目前在细胞RNA中已经识别到了超过100种化学修饰,其中RNA甲基化修饰在生命活动中有着非常重要的作用(Xu et al 2020)。RNA甲基化是指在甲基转移酶的催化下,在RNA分子上的某一个原子上添加一个甲基基团(CH3)。RNA甲基化修饰类型有很多,比如:m6A RNA甲基化﹑m5C RNA甲基化﹑m1A RNA甲基化、m7G RNA甲基化等(Oerum...
位点特异性切割和放射性标记,随后通过连接辅助提取和TLC(SCARLET)可以以单碱基分辨率定量检测RNA中的修饰位点,这目前是RNA修饰的“金标准”。因为RNase H会消化RNA/DNA杂交体中的RNA,但不消化RNA/2-O-甲基化DNA杂交体中的RNA,使用RNase H暴露于预定义的m6A位点进行放射性标记。使用DNA连接酶将32P标记的RNA片段连接...
蛋白甲基化修饰检测是通过一系列实验方法来分析和确定蛋白质中的甲基化修饰状态和位置。常用的方法包括质谱分析、抗体识别和甲基化特异性酶切。质谱分析是一种高效准确的方法,可以通过测量蛋白质的质量和离子化性质来鉴定和定量甲基化修饰。抗体识别则利用特异性抗体与甲基化蛋白质结合,以检测甲基化的存在和程度。甲基...
组蛋白H3和H4甲基化乙酰化多重修饰检测Kit-实验操作指南(EPT-P-3100,P-3102) ,快速高效的实验步骤,仅需2.5小时;高灵敏度,检测限低至0.5ng, 适用于human,小鼠,大鼠 以及其它物种样品(大部分植物,真菌,细 - 艾美捷科技于20240110发布在抖音,已经收获了347.7万个
3. 将片段化后的RNA分成两份。一份加入带有m6A抗体的免疫磁珠,对含有m6A甲基化的mRNA片段进行富集(备注3)。另一份作为control,直接构建常规的转录组测序文库。 4. 对m6A抗体免疫磁珠进行富集,带有m6A的mRNA片段进行回收后,按照转录组的建库流程构建常规的测序文库。
1 植物DNA的甲基化修饰 DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,其调控机制和生物学功能是目前研究最为深入的。DNA甲基化是指DNA特定碱基在甲基转移酶的催化下,从甲基供体获得一个甲基集团的化学修饰。S-腺苷甲硫氨酸(S-adenyl methionine, SAM)是广泛存在于各类细胞中的甲基供体。近年来的研究显示,甲基化可以发生在...
m6A甲基化是转录后调控中重要的表观遗传修饰方式,它普遍存在于病毒和真核生物中。MeRIP-seq(高通量测序法)作为m6A修饰的检测方法,其具有针对全基因组范围内检测m6A的存在;能够明确每个基因的修饰水平,进行组与组之间比较等优势。接下来就让小编带大家详细了解m6A和MeRIP-seq。 1.在介绍m6A之前,首先认识一下什么...
蛋白质翻译后常见修饰鉴定,如磷酸化、乙酰化、泛素化、甲基化等,尤其对未知修饰的氨基酸位点进行检测,提供最直接的实验鉴定。研究者可构建带有标签的靶基因载体转染表达,而后亲和纯化,或者预先用蛋白pan 抗体IP富集待检测靶蛋白再送样,进行质谱检测。 特点适合未知修饰的氨基酸位点进行检测; 开放的检测平台 蛋白质磷酸...
甲基化的位置特异性检测。图片来源:Nature Communications 三 STEM-PCR检测单碱基突变 对比限制性酶消化,潜在的STEM-PCR机制可以实现更通用的方法,可通过使用PNA修饰的构建体来说明(图a)。使用PNA修饰可以区分单碱基错配以及阻断聚合酶进展,PNA寡核苷酸的较高结合亲和力稳定了P1,同时也抑制了TFP在FR的5′端的...
蛋白甲基化修饰检测是通过一系列实验方法来分析和确定蛋白质中的甲基化修饰状态和位置。常用的方法包括质谱分析、抗体识别和甲基化特异性酶切。质谱分析是一种高效准确的方法,可以通过测量蛋白质的质量和离子化性质来鉴定和定量甲基化修饰。抗体识别则利用特异性抗体与甲基化蛋白质结合,以检测甲基化的存在和程度。甲基化...