Light Gradient Boosting Machine (LightGBM) 通过计算信息增益 (IG) 分数来选择高重要性特征来执行特征选择。 尽管使用网格搜索的自动超参数调整在工厂中得到广泛实施,但自动化特征工程在很大程度上被忽视了。在最近的一项研究中,LightGBM 选择的具有高 IG 分数的 SNP 特征与从 GWAS 中鉴定的峰值 SNP 一致,表明算法...
Light Gradient Boosting Machine (LightGBM) 通过计算信息增益 (IG) 分数来选择高重要性特征来执行特征选择。 尽管使用网格搜索的自动超参数调整在工厂中得到广泛实施,但自动化特征工程在很大程度上被忽视了。在最近的一项研究中,LightGBM 选择的具有高 IG 分数的 SNP 特征与从 GWAS 中鉴定的峰值 SNP 一致,表明算法...
2021年9月20日,中国农业大学农学院、国家玉米改良中心王向峰教授与华中农业大学严建兵教授课题组在著名国际学术期刊Genome Biology上发表了题为“LightGBM: accelerated genomically designed crop breeding through ensemble learning”的方法学研究论文。中国农业大学的闫军博士、徐悅彤博士生为该论文的共同第一作者,也是CropGBM...
四个框表示了使用LightGBM进行基因优先排序的特征重要性分析、图卷积网络(GCN)模型整合多组学数据、使用基因型对玉米品系进行分类的OPTICS算法,以及使用t-SNE可视化玉米种群结构的应用。 缩写词:ANN,人工神经网络;CART,分类和回归树;CL,对比学习;CNN,卷积神经网络;DBSCAN,基于密度的带有噪声的应用空间聚类;eGWAS,表达...
LightGBM: accelerated genomically designed crop breeding through ensemble learning. Genome Biol. Fengchao Cui, Geli Taier, Manli Li, Xiaoxia Dai, Nan Hang, Xunzhong Zhang, Xiangfeng Wang, Kehua Wang (2021). The genome of the warm-season turfgrass African bermudagrass (Cynodon transvaalensis). ...
在生物学中应用的监督学习和无监督学习方法。四个框表示了使用LightGBM进行基因优先排序的特征重要性分析、图卷积网络(GCN)模型整合多组学数据、使用基因型对玉米品系进行分类的OPTICS算法,以及使用t-SNE可视化玉米种群结构的应用。 缩写词:ANN,人工神经网络;CART,分类和回归树;CL,对比学习;CNN,卷积神经网络;DBSCAN,基于...
在生物学中应用的监督学习和无监督学习方法。四个框表示了使用LightGBM进行基因优先排序的特征重要性分析、图卷积网络(GCN)模型整合多组学数据、使用基因型对玉米品系进行分类的OPTICS算法,以及使用t-SNE可视化玉米种群结构的应用。 缩写词:ANN,人工神经网络;CART,分类和回归树;CL,对比学习;CNN,卷积神经网络;DBSCAN,基于...
文章详细介绍了机器学习在植物生物学中的应用，涉及监督学习、无监督学习方法以及在生物学领域的具体应用，如LightGBM、图卷积网络（GCN）等技术。通过案例研究，如多组学数据关联研究（MODAS），文章展示了如何通过数据降维技术提高致病基因映射分辨率。MODAS利用多种无监督学习技术加速群体规模的多组学分析，通过...
四个框表示了使用LightGBM进行基因优先排序的特征重要性分析、图卷积网络(GCN)模型整合多组学数据、使用基因型对玉米品系进行分类的OPTICS算法,以及使用t-SNE可视化玉米种群结构的应用。 缩写词:ANN,人工神经网络;CART,分类和回归树;CL,对比学习;CNN,卷积神经网络;DBSCAN,基于密度的带有噪声的应用空间聚类;eGWAS,表达...