进入搜索结果页面后,选择Gene类型,可以看到该基因在13个物种中有记录。 寻找基因 在检索到的Gene结果表格中,选择感兴趣的物种分别点击链接进行下载。 选择物种 我们这里以human(人类)、mouse(小鼠)、monkey(猴子)为例,进入基因页面并点击右上角的Download Datasets按钮,选择Gene Sequence (FASTA)格式下载基因序列
来自专栏 · 物种鉴定 目前系统发育和进化分析主要依赖于组学数据。然而,在核心分析之前,传统方法通常涉及复杂而耗时的程序,包括高通量reads的组装、去除污染、基因预测、同源性搜索、同源性分配、多序列比对和矩阵裁剪。在处理大量数据集时,这些过程大大影响了研究效率。PhyloAln是一种方便的基于参考的工具,能够直接将高...
之前提到的clustalo, muscle, mafft 适用于几千到几万条序列的多序列比对，在比较基因组学的分析中，...
解析 一般选在分类上高一级的物种. 比如针对科建进化树,需要选一个同目,接近的另一科的某个物种. 最好多试几个 分析总结。 比如针对科建进化树需要选一个同目接近的另一科的某个物种结果一 题目 建进化树时,最终应该跟哪一些物种序列比对后,建进化树?这些物种应该如何去找? 答案 一般选在分类上高一级的...
不同物种之间蛋白序列比对以及结构域查询不同物种之间蛋白序列比对以及结构域查询首先从NCBI PROTEIN内检索所需要的蛋白(P2X7大鼠源和人类源为例)粘贴GI号然后打开BLAST里面的protein blast输入GI号,然后BLAST 相似度为80% 结构域查询查找所需物种的蛋白序列FASTA格式选定CD-search 下载文档 收藏 分享 赏 0...
不同物种之间蛋白序列比对以及结构域查询 首先从NCBI PROTEIN内检索所需要的蛋白(P2X7大鼠源和人类源为例)粘贴GI号 然后打开BLAST里面的protein blast 输入GI号,然后BLAST 相似度为80% 结构域查询 查找所需物种的蛋白序列FASTA格式 选定CD-search 将FASTA格式的序列输入 Precalculated...
浙江省全新物种“苕溪鱲”是怎么被发现的？各大流域标本采集、DNA序列比对技术“显真彰”近日，在杭州余杭与湖州德清两地的苕溪流域发现了一个全新鱼类物种——苕溪鱲(liè)，一种鲤形目鲤科鱲属的鱼类。该物种的发现，是当地野生动植物本底调查的标志性成果，意味着苕溪有了一个以自己名字命名的物种。美丽的苕溪鱲...
3.不同物种体内会存在相同功能的蛋白质,编码该类蛋白质的DNA序列以大致恒定的速率发生变异。猩猩、大猩猩、黑猩猩和人体内编码某种蛋白质的同源DNA序列比对结果如下表,表中
可以比对的，序列太多可能比对的比较慢。
您好，建议用序列两两比对算法做不同物种间核苷酸序列和氨基酸序列的同源性比对。将序列比对用于进化分析时，处于相同位置的氨基酸/核苷酸位点则被认为在进化上是同源的，并且具有共同的祖先。