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R语言物种组成堆积图 r语言分类画图 相信很多人都看到过上面这种方块图,有点像“华夫饼图”的升级版,也有点像“热图”的离散版。我在一些临床多组学的文章里面看到过好几次这种图,用它来展示病人的临床信息非常合适,我自己也用R包或者AI画过类似的图。今天给大家演示一下,如何用ggplot2里面的geom_tile函数画这...
通过这种方式，你可以轻松地绘制出只显示丰度前10或前20的物种堆积图，并将剩余的物种归为“others”。...
至此,我们已经成功绘制了物种组成堆积图。下面是完整的代码示例: # 加载ggplot2包library(ggplot2)# 创建示例数据data<-data.frame(Sample=c("Sample 1","Sample 2","Sample 3"),Species_A=c(0.2,0.3,0.1),Species_B=c(0.4,0.2,0.3),Species_C=c(0.1,0.4,0.2))# 创建绘图对象p<-ggplot(data,aes(x...
通过堆积图选项进行绘制。1、打开电脑桌面上的excel图标，并建立空白文档。2、将绘图数据录入到工作表中，按年度和项目区分。3、将鼠标光标放置于数据单元格内，并点击上方的插入按钮并找到堆积柱形图选项。
图示为物种属水平的相对丰度堆积柱状图，特别展示了前15个丰度最高的属，其余的属则归类为“others”。下面将通过示例数据和代码展示如何制作此类图表。数据与准备工作由于原作者的数据具有权限限制，这里我们将使用Phylum水平的绝对丰度矩阵作为演示。在开始作图前，需要导入数据并进行必要的数据处理。绘制与...
简介: 跟着Nat Commun学作图 | 3.物种丰度堆积柱状图 读图 Snipaste_2021-11-15_21-09-21 该图为分组的物种属水平的相对丰度堆积柱状图。其中只显示了前15丰度的属,剩下的属都归于others里 示例数据及作图前准备 由于作者给开源的数据设置了权限,就用手上的Phylum水平的绝对丰度矩阵来作为示例。 导入数据 # ...
流石滩是位于雪线之下的过渡地带,是高山地区独有的生态系统,通常由大大小小的石块堆积而成,植被稀疏,但零星生长的植被特有性强,演化出新物种的概率高。下图为某山地等高线、7月等温线及雪线分布示意图。完成下面小题。1. 图示流石滩最可能出现在( ) A. 疏草寒漠带 B. 高山草甸带 C. 积雪冰川带 D. 灌丛草...
物种丰度排序堆积柱形图及处理间各物种丰度非参数检验多组比较的R图形可视化 再美的可视化图形若缺少了统计检验就失去了灵魂而变得华而不实 测试数据及代码链接:https://pan.baidu.com/s/1LJzCNqJe9OcfUmhH9jfvsw 提取码:9ifa 因公众号文章不可修改,如以上链接失效,或想获取代码的更新版,请在“宏基因组”公众...
制作物种丰度堆积柱状图，你可以遵循以下步骤：数据准备：获取物种丰度数据，通常这些数据以矩阵形式存在，行代表样本，列代表物种或分类单元。对数据进行预处理，如计算相对丰度，并筛选出前15个丰度最高的属，将剩余的属归类为“others”。选择绘图工具：可以使用Python中的matplotlib库或R语言中的ggplot2包...