普通燕麦(Avena sativa,2n=6x=42,AACCDD)作为全球重要的粮食与饲料作物,对贫瘠边缘环境具有极强适应力,但受限于庞大基因组(约11Gb)、高重复序列占比及多倍体复杂性,其基因组研究与分子育种进展显著滞后于其他主粮作物。 2025年2月,河北大学杜会龙教授团队在国际权威期刊Molecular Plant上在线发表了题为A gap-free c
通过 TBtools 软件在燕麦基因组中进行 BLASTP 和 Hmm 搜索,鉴定出燕麦中的 EPF/EPFL 基因家族成员;然后,利用生物信息学工具分析基因的理化性质、保守结构域、基因结构和染色体定位;接着,通过系统发育分析构建燕麦与其他物种 EPF/EPFL 基因的进化树,探讨其进化关系;最后,运用 qRT-PCR 技术检测基因在不同组织及干旱(...
磷酸盐转运蛋白(PHT)基因家族在不同环境条件下,对磷酸盐(Pi)的吸收、运输和体内平衡起着关键作用。本研究对燕麦(Avena sativa)的PHT基因家族进行了全面的全基因组鉴定和特征分析。在 OT3098 基因组中,共鉴定出 32 个非冗余的AsPHT基因,分为两个亚家族:AsPHT1(21 个基因)和AsPHO(11 个基因)。AsPHT1蛋白主要...
a multi-omics database的论文,公布了全球首个超过10 Gb的T2T(端粒到端粒)无间隙栽培六倍体燕麦的参考基因组,并整合基因组、群体变异组、转录组、表型组、重要农艺性状相关基因等信息建立了全球首个燕麦多组学综合数据库OatOmics,
燕麦起源于燕麦属,AA和CCDD杂交得到异源三倍体ACD,ACD不育,需诱导其染色体数目加倍后才能形成AACCDD的燕麦,故燕麦是起源于同一祖先的异源六倍体,A、B错误;燕麦多倍化的原理是染色体数目变异,是可遗传的变异,C正确;燕麦中A和D基因组由A/D基因组祖先进化而来,二者与C基因组亲缘关系较远,故A和D基因组同源性大,...
2022年我国科学家发布燕麦基因组,揭示了燕麦的起源与进化,燕麦进化模式如图所示。下列相关叙述正确的是 ( ) 厂 A. A、燕麦是起源于同一祖先的同源六倍体 B. B、燕麦是由AA和CCDD连续多代杂交形成的 C. C、燕麦多倍化过程说明染色体数量的变异是可遗传的 D. D、燕麦中A和D基因组同源性小,D和C同源性大 ...
2025年1月8日,河北大学的杜会龙教授团队在国际权威期刊《Molecular Plant》上发表了一项重要研究,宣布建立全球首个无间隙栽培六倍体燕麦参考基因组,并整合多组学数据,推出燕麦多组学综合数据库OatOmics。这一成果为燕麦功能基因组学的深入研究和分子设计育种提供了坚实的平台,标志着燕麦基因组学研究迈入了新阶段。
and OatOmics, a multi-omics database的论文,公布了全球首个超过10 Gb的T2T(端粒到端粒)无间隙栽培六倍体燕麦的参考基因组,并整合基因组、群体变异组、转录组、表型组、重要农艺性状相关基因等信息建立了全球首个燕麦多组学综合数据库OatOmics,为燕麦功能基因组学等基础研究和分子育种等应用研究提供了全面的共享...
随着燕麦基因组学研究的持续深化,OatOmics数据库将不断扩展与完善。研究团队计划定期更新种质资源、基因变异信息和表型数据,成为全球燕麦研究与育种的核心平台。同时,研究将推进种质资源的规模化基因型与表型鉴定,全面掌握资源的全基因组信息、生长特性及生产性状,进而挖掘优良性状与关键基因。
突破性组装:燕麦基因组的完整图谱 研究团队运用了PacBio HiFi、ONT、Illumina和Hi-C等多种先进测序技术,成功构建了栽培燕麦的完整基因组图谱,其大小达10.99Gb,涵盖了所有21个着丝粒和42个端粒区域。这种高连续性、高完整性和高准确性的基因组组装,不仅填补了之前的研究空白,还为进一步揭示燕麦基因组的“暗物质”区域...