这图确实比一般的火山图美观且简洁。 火山图的意义 火山图可用于展示两组样本间基因表达水平差异的分布状况。 横轴log2 fold change差异表达倍数(Fold Change值,简称FC),差异越大的基因分布X轴在两端。 纵坐标用-log10p-value表示,对P值进行-log10的转化。转化后,值越大就表示差异越显著。 数据格式 绘制 setwd...
火山图为描述表达差异而存在 横轴表示差异表达倍数(log2 fold change表示,Fold Change值,简称FC,根据log2 fold change值的正负判断这些基因的表达量是上升了还是下降了),差异越大的基因分布X轴在两端。 纵坐标表示差异的显著性,用-log10 p-value表示,对P值进行-log10的转化,-log10(p-value=0.05)约等于1.30,(...
百度试题 结果1 题目火山图的纵坐标表示( ) A. log2 Fold Change B. Fold Change C. –(P-value) D. –log10(P-value) 相关知识点: 试题来源: 解析 D 反馈 收藏
标准的火山图常用于展示显著差异表达的基因,这里有两个关键词:显著是指P<0.05,差异表达一般我们按照Fold Change(倍数变化)>=2.0作为标准。 当我们拿到基因表达的P值和Fold Change后,为了用火山图展示结果,一般需要把倍数进行Log2的转化,比如某基因在实验组表达水平是对照组的4倍,log2(4)=2,同样的如果是1/4,也...
标准的火山图常用于展示显著差异表达的基因,这里有两个关键词:显著是指P<0.05,差异表达一般我们按照Fold Change(倍数变化)>=2.0作为标准。 当我们拿到基因表达的P值和倍数后,为了用火山图展示结果,一般需要把倍数进行Log2的转化,比如某基因在实验组表达水平是对照组的4倍,log2(4)=2,同样的如果是1/4,也就是0....
此时 log2_foldchange 里所有的数都是有效数字了，原来 NaN / Inf 的地方都变成 0 啦~前面我们也交代过Y轴是 p-value 取 log10 ，这时得到的是一个负值，我们再把它变成整数所以乘以 -1 即：此时，X,Y轴都准备好了，我们开始作图 这张图虽然是火山图的样子了，但肯定是不符合paper的要求的...