一、火山图简介 那么如何看懂一张火山图所包含的信息呢?首先需要知道,火山图的横坐标通常用log2(fold change)表示,差异越大的基因分布在两端,纵坐标用-log10(pvalue)表示,T检验显著性P值的负对数。由于P值越小表示越显著,所以我们进行-log10(P value)转化后,转化值越大表示差异越显著。通常差异倍数越大的基因...
火山图为描述表达差异而存在 横轴表示差异表达倍数(log2 fold change表示,Fold Change值,简称FC,根据log2 fold change值的正负判断这些基因的表达量是上升了还是下降了),差异越大的基因分布X轴在两端。 纵坐标表示差异的显著性,用-log10 p-value表示,对P值进行-log10的转化,-log10(p-value=0.05)约等于1.30,(...
1分钟读懂生信图,先从火山图开始火山图怎么看⁉️ 1⃣️坐标轴:横轴是log2(Fold change),显示差异倍数(FC),点越偏离中心,表示差异倍数越大;纵轴是-log 10 (adj. p-value),显示显著性,点越靠图的顶部,表示差异越显著; 2⃣️点:图中每个点代表一个检测到的基因(或蛋白、代谢物等),图中这些点...
百度试题 结果1 题目火山图的纵坐标表示( ) A. log2 Fold Change B. Fold Change C. –(P-value) D. –log10(P-value) 相关知识点: 试题来源: 解析 D 反馈 收藏
标准的火山图常用于展示显著差异表达的基因,这里有两个关键词:显著是指P<0.05,差异表达一般我们按照Fold Change(倍数变化)>=2.0作为标准。 当我们拿到基因表达的P值和Fold Change后,为了用火山图展示结果,一般需要把倍数进行Log2的转化,比如某基因在实验组表达水平是对照组的4倍,log2(4)=2,同样的如果是1/4,也...
标准的火山图常用于展示显著差异表达的基因,这里有两个关键词:显著是指P<0.05,差异表达一般我们按照Fold Change(倍数变化)>=2.0作为标准。 当我们拿到基因表达的P值和倍数后,为了用火山图展示结果,一般需要把倍数进行Log2的转化,比如某基因在实验组表达水平是对照组的4倍,log2(4)=2,同样的如果是1/4,也就是0....
咱们一个一个来,由易入难,今天就先讲讲火山图怎么看,代表的是什么结果!1)坐标轴:横轴是log2(Fold change),显示差异倍数(FC),点越偏离中心,表示差异倍数越大;纵轴是-log 10 (adj. p-value),显示显著性,点越靠图的顶部,表示差异越显著;2)点:图中每个点代表一个检测到的基因(或蛋白、代谢物等),图中...