我们通常将包含两个相对完整的 LTRs 和已识别的 PPT 和 PBS 位点的元素,且两侧有 TSD 的 LTR 定义为 Intact LTR(A)。由于 LTR-RTs 两端序列非常相似,LTR-RTs 内可发生重组,导致内部元件消失,形成 solo LTR(C),而 solo LTR 的数量表明了一个基因组中 LTR 去除的频率和效率。此外 LTR 发生缺失、易位可形...
我们通常将包含两个相对完整的 LTRs 和已识别的 PPT 和 PBS 位点的元素,且两侧有 TSD 的 LTR 定义为 Intact LTR(A)。由于 LTR-RTs 两端序列非常相似,LTR-RTs 内可发生重组,导致内部元件消失,形成 solo LTR(C),而 solo LTR 的数量表明...
我们通常将包含两个相对完整的 LTRs 和已识别的 PPT 和 PBS 位点的元素,且两侧有 TSD 的 LTR 定义为 Intact LTR(A)。由于 LTR-RTs 两端序列非常相似,LTR-RTs 内可发生重组,导致内部元件消失,形成 solo LTR(C),而 solo LTR 的数量表明了一个基因组中 LTR 去除的频率和效率。此外 LTR 发生缺失、易位可形...
LTR-RTs :是反转座⼦中的⼀种，因其两侧存在长的末端重复⽽得名。不含长末端重复的反转座⼦统称 non-LTR-RTs，主要包含短散在重复(SINE)和长散在重复(LINE)。2. LTR的分类 动植物基因组中存在⼤量转座⼦，尤其是植物基因组中。LTR 因其数量多且 LTR 长度巨⼤，在植物转座⼦中具有较⾼的...