转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
更详细地了解特定细胞或细胞样品中的 RNA(编码和非编码)含量,对于更好地理解正常生物学或疾病进展中的不同表达非常重要。 而微阵列
RNA测序（RNA-seq）是转录组学研究的重要工具，也是生命科学领域最常用的技术之一。相比于传统通路研究低维度、低通量的局限性，转录组学有以下优势：1）能够动态考察细胞基因组的表达，多维度地反映差异变化；2）可用于研究占RNA绝大部分的非编码RNA，研究其结构以及在细胞生命活动中的重要调控作用；3）与蛋白组学...
本质上,DGE-Seq和3 '端测序是基于标签的方法,使用一个片段来代表一个转录本。虽然对基因表达分析很有效,但它们可能比“鸟枪式”RNA-Seq具有更高的可变性,后者一个转录本由多个片段表示。片段化、接头连接和PCR的偏差可能使基于标签的数据更容易产生批量效应。
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5. 单细胞RNA-seq的数据挖掘 单细胞 RNA-seq 为我们了解组织的组成等提供非常好的工具,而单细胞测序的效果也取决于我们到底测多少细胞,一般而言几百个细胞的单细胞测序不仅仅捕获常见的细胞成分,也会捕获稀少类型的细胞。由于 RNA 降解,细胞的凋亡和实验误差等原因,一些数据将会被排除,不纳入数据分析环节,因此初始...
RNA-Seq是一种基于高通量测序技术的转录组学研究方法,通过对生物样品中所有RNA分子进行测序,从而获得基因表达的全面信息。今天,我们来详细讲解RNA-Seq的原理和应用。🔍 什么是RNA-Seq? RNA-Seq,即RNA测序技术,也称为转录组测序技术,是一种通过观察基因表达来分析整个基因组的技术。主要测序对象包括信使RNA(mRNA)、...
RNA-seq数据分析 判断测序的质量 分析的第一步,一般是先把测到的RNA片段,先mapping(比对)到基因组上。在比对完后,可以先看一下,有多少RNA片段是在靠近基因的5'端位置,又有多少片段在是靠近基因的3'端位置。 上图就是把所有的基因,都按其外显子的长度拉直,然后归一化到“0 - 100”的长度。看比对上的片段...
1. 双荧光素酶检测验证RNA与RNA互作 双荧光素酶检测可用于验证RNA与RNA互作。其基本原理是将待测RNA片段分别与两种酶报告基因构建融合表达载体,各自产生不同类型的荧光信号。实验中,当两种含有所研究RNA片段的融合蛋白在细胞内表达时,若这两种RNA之间存在互作,则会改变各自的构象或稳定性,进而影响各自所连接的荧光素...