测序深度(Sequencing Depth):测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小(Genome)的比值,它是评价测序量的指标之一.测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降.重测序的个体,如果采用的是双末端或Mate-Pair方案,当测序深度在10~15X以上时,基因组覆盖度和测序错...
测序深度可以理解为对一段序列上的区域重复检测的次数,比如一个序列被上某个片段被检测了30次就是30x,深度越大,越准确,覆盖度就是对你的目的基因所覆盖的程度,比如你的序列是有30bp但是由于测序的时候某些区域没有测到,只测到了27bp大小片段,那就是27/30等于90 ...
覆盖率和读取深度是衡量文库测序情况的指标。从视觉上看,覆盖率是从水平方向来说的,而读取深度是从垂直方向来说的。覆盖率或覆盖宽度回答了“测序覆盖了多少样本?”。它可以表示为测序读数覆盖的碱基百分比,例如95%的覆盖率表明样本中95%的碱基已经测序。 读取深度或测序深度表示检测到特定核苷酸的reads数量。这可以作...
测序深度(Sequencing Depth):测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小(Genome)的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而下降。重测序的个体,如果采用的是双末端或Mate-Pair方案,当测序深度在10~15X以上时...
测序深度与基因组覆盖度之间是一个正相关的关系,测序带来的错误率或假阳性结果会随着测序深度的提升而...