泛素化相关分子(酶、底物等)的功能异常或调控是许多疾病的根源,包括发育障碍、癌症、神经退行性疾病等,靶向泛素化相关分子的调控为这些疾病的干预及治疗提供了全新的视角。基于泛素化修饰的复杂性,关于泛素化的研究将会分为两期内容给大家介绍。在本期文章中,我们将重点为大家介绍泛素分子的结构、泛素化修饰的机制
2.3去泛素化泛素化是一个被严格调控的可逆过程,去泛素化酶(Deubiquitinating enzymes,DUBs)可以通过水解泛素分子之间或泛素与底物蛋白之间的肽键或异肽键,来逆转泛素化修饰(Fennell et al., 2018)。去泛素化酶对泛素化过程不仅起着抑制作用,而且可以通过分解泛素化抑制因子、再循环泛素分子、校对泛素化进程等方式...
4. 确定具体修饰酶后,进行泛素修饰类型鉴定:通过使用HA-Ub-WT和HA-Ub-MUT(K6/K11/K27/K29/K33/K48/K63分别突变为R,使该位点无法被泛素化)载体,分别与泛素连接酶(E3)和修饰底物共转染细胞,通过CoIP-WB检测底物泛素化水平,明确泛素连接酶对修饰底物的泛素修饰类型。5. 靶标修饰位点鉴定:结合在线预...
组学方法:泛素化修饰蛋白组学 研究结论:凋亡诱导因子(AIF)在调节细胞存活和凋亡中发挥双重作用,本研究表明OTU去泛素化酶1 (OTUD1)通过去泛素化在AIF的两个功能之间起着连接作用。AIF在K244的去泛素化破坏了正常的线粒体结构并危及氧化磷酸化,而AIF在K255的去泛素化增强了其DNA结合能力以促进部分磷酸化。此外,OTU...
利用蛋白质免疫印记法可以检测蛋白质的泛素化,并分析在不同生理条件下泛素化蛋白的表达水平和泛素化程度。其基本原理是泛素化修饰抗体可以识别并结合泛素化蛋白质。首先从细胞或组织样本中提取蛋白质,然后通过SDS-PAGE电泳分离蛋白质,将分离的蛋白质转移到膜上,用抗泛素化抗体孵育。如果蛋白质发生泛素化,那么可以...
使用特定于泛素化修饰的肽段的质谱标记,例如泛素化产生的特有的肽段末端肽,以识别蛋白质上的泛素化修饰位点。lc-ms/ms分析泛素化修饰蛋白质组学在生物医学研究中应用如下:1、疾bing机制的研究:通过比较健康与疾bing状态下的泛素化模式,揭示疾bing发生的分子机制。2、yao物靶标的发现:识别与疾bing相关的特定...
其次,激活的泛素通过硫酯键与E2酶结合。最终,激活的泛素通过E2酶或是E3酶连接到底物蛋白。质谱可以分辨蛋白质修饰前和修饰后分子量上的变化,因此只要知道靶蛋白翻译后修饰前后分子量的精确变化,我们就能对泛素化修饰方式进行鉴定和定量。图 泛素化修饰蛋白质组学流程图 服务流程 服务流程 蛋白提取——蛋白酶切—...
当泛素的C末端甘氨酸被去掉时,泛素不再连接磷脂,说明泛素分子是通过其G76位连接到酵母磷脂上。作者还检测到双泛素修饰的存在,表明磷脂可被多泛素化修饰。此外,作者在HeLa细胞膜上也检测到类似修饰,且证实泛素分子也是通过C端甘氨酸连接膜上的磷脂。因此,作者认为磷脂的泛素修饰在哺乳动物中是保守的。作者还通过...
在复杂的细胞景观中,蛋白质是主要的功能分子,蛋白质翻译后修饰(PTM)可以作为开关可逆地控制生物学功能。其中,泛素化修饰作为一种重要的翻译后修饰,在真核细胞中调节着大多数蛋白质和生物过程。然而,目前泛素化修饰的研究主要集中在功能层面,对其位点特异性的占用率和周转率信息的系统性研究较少。事实上,这些基本...
泛素化和去泛素化修饰广泛参与了植物的生长发育、胁迫应激和代谢调控等多个过程。泛素化通过将小分子泛素共价结合到目标蛋白上后,目标蛋白质进入蛋白酶体进行降解,这可以调控目标蛋白的活性、位置和相互作用。而去泛素化则通过去除目的蛋白上已结合的泛素,恢复蛋白质的稳定性和功能,确保细胞功能的正常运作。泛素化与...