2021年12月,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了染色体水平的基因组组装和注释,绘制了油松基因组的染色体甲基化图谱,为油松独特适应性和发育研究、...
2021年12月,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了染色体水平的基因组组装和注释,绘制了油松基因组的染色体甲基化图谱,为油松独特适应性和发育研究、...
研究者利用PacBio测序、Hi-C辅助组装等技术,组装获得了25.4 Gb染色体水平的油松基因组。通过使用来自760个生物样本的大规模RNA-seq数据来辅助基因结构注释,揭示油松基因组扩展、生殖过程和适应性进化的多重基因组特征和分子机制,给针叶树进化研究提供了新思路,为今后进一步开展针叶树适应与发育研究提供了数据参考。 材料...
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第三部分,作者用一个更大的角度去描述油松基因组。 首先从整体上看油松的基因组重复序列和甲基化水平很高,三种甲基化分别达到了88.4%, 81.6%和 2.0%,特别是CG和CHG甲基化远高于常见物种,甲基化的含量与重复序列的含量明显的正相关,在这12条染色体上每一条都显示出这种特点(Fig S5a)。
近日,顶尖学术期刊《细胞》上发表了一篇有关油松的研究论文。由北京林业大学钮世辉教授领衔的研究团队,联合瑞典、美国等多个国家的学者,首次完成了染色体规模的油松基因组组装,这一成果为我们理解针叶树适应性演化的关键特征提供了重要见解。 过去二十年随着测序技术的进步,人们已经解读出了很多物种的基因组信息,然而针叶...
油松基因组长达25.4G,有12条染色体。裸子植物的基因组都很大(17–35 Gb),这是由于TE扩张导致的。除了基因间的TE,油松基因内含子也包含TE。裸子植物内含子与被子植物比较长的多,之前的裸子植物文章也有研究。此文章还提到,拥有长内含子的基因表达量也很高。高水平的甲基化使TE消除速度减慢,从而导致油松基因组扩张。
近期,北京林业大学生物科学与技术学院联合安诺优达在国际知名期刊Cell(IF:41.582)在线发表了题为“The Chinese pine genome and methylome unveil key features of conifer evolution”的研究文章,研究者对油松进行了染色体水平的基因组组装和注释,绘制了油松基因组的染色体甲基化图谱,为油松独特适应性和发育研究、生殖生物...