本数据库是一个综合性的杂交水稻数据库(http://ricehybridresource.cemps.ac.cn/#/),涵盖了从1976年至2017年间发布的486个商业杂交水稻品种信息、基因组变异、表型与全基因组关联数据信息,共计3,325个样品,5 百万+变异位点和17套表型数据,为现代杂交水稻育种提供了宝贵的资源。 Figure 2.1: 首页设计采用平面式...
首先,打开水稻数据库的网站,并选择相应的搜索功能。然后,输入你感兴趣的基因名称或序列相关的关键词。点击搜索按钮后,数据库将返回与你搜索相关的结果,其中包括该基因的序列信息。 2. 如何利用水稻数据库搜索特定序列的同源基因? 如果你想在水稻数据库中搜索特定序列的同源基因,你可以使用数据库的BLAST(Basic Local A...
水稻FPKM数据库可以用于研究水稻的基因表达模式,比如在不同生长阶段、不同组织、不同环境条件下的表达情况。通过对水稻FPKM数据库的分析,可以了解水稻基因在不同条件下的表达模式,从而为水稻的育种和种植提供科学依据。 此外,水稻FPKM数据库还可以用于研究水稻的基因调控网络和信号通路。通过对水稻FPKM数据库的分析...
中国水稻品种及其系谱数据库(http:www.ricedata.cnvariety),是国家水稻数据中心(http:www.ricedata.cn)的一个子平台,主要收录省级以上审定品种、大面积推广品种、外引品种以及地方性农家品种,品种检索和系谱追溯是它的两个核心功能.在品种及其系谱的收集过程中,发现部分种质的名称容易出错和混淆. ...
近日,华中农业大学作物遗传改良全国重点实验室、湖北洪山实验室张建伟教授课题组联合国内外高校与科研团队,以代表亚洲稻群体结构的高质量基因组为对象,构建并全面分析基因组倒位图谱,建成了世界上首个基于同源基因簇的水稻泛基因组综合数据库——水稻基因索引数据库,为全球水稻研究学者提供免费在线检索和分析服务。水稻...
本数据库平台台的特色中国水稻品种种及其系谱、、指纹数据库库实现过程:(1)服务器系统::WindowsServer2008+IIS6.0;(2)底层数据库::SQLServer2005;(3)开发技术:DHTML(HTML+CSS+javascript);ASP.net(运行环境);VB.net(编程语言);SVG+VML(可缩放矢量图图形,程序直直接绘图)本数据库平台台的特色中国水稻品种种及其...
目前,数据库储存于华中农业大学,向全球开放免费使用。亚洲栽培稻是世界一半人口的主食。据记载,全球共有多达78万份水稻种质材料,其中国际水稻研究所种质资源库里收藏的亚洲稻种质及其野生近缘种就达13万多份。张建伟教授课题组所建成的水稻基因索引数据库,是从13万多份亚洲稻种质中选取具有遗传多样性代表的3000份...
国家水稻数据中心 案例单位:水稻研究所 访问网址:http://www.ricedata.cn 建库时间:2005年 数据库内容:该数据库以水稻为研究对象,广泛整合了品种审定公告、中英文文献以及公共数据库中的水稻品种、基因、系谱、本体和文献等多学科数据。截至2020年9月30日,已累计收录数据超过262万条,涵盖品种库、基因库、本体...
科研人员进一步构建了水稻功能基因数据库,通过文献挖掘整合了全球范围内报道的水稻功能基因共计2545个。此外,他们还开发了基于浏览器的遗传图谱生成工具及基因结构图生成程序,并对水稻产量关键性状相关的数量性状基因座(QTL)进行了系统的图谱整合。此平台不仅收录了超过2300条水稻相关术语,还创新性地将该系统应用于...
国家水稻数据中心是中国水稻研究所创建的一个以水稻为核心,服务于育种需求的大型数据库,数据包含种质、突变体、分子标记、基因、QTL、文献资源等。 https://u.wechat.com/MG7h6BUWjGYgqpI1FCdQbFA (二维码自动识别) 2.粳稻日本晴基因组注释计划http://rapdb.dna.affrc.go.jp/ ...