从分子水平看,当今生物有许多共同特征,不同生物的相同蛋白质分子的差异性可以解释生物种类亲缘关系的远近。下图是甲与其他四种生物的β-珠蛋白前40个氨基酸的序列比对结果示意图
②氨基酸多序列比对:这个主要步骤在软件下载那个网址下方有,这里列出一种更简单的方法: 直接Sequence ——》Alignment ——》Multiple,导入你设置好的多序列文件,多个序列的顺序可以自行设置,比如和你做的进化树保持同样顺序等等,格式见下图: 大于号区分不同序列 默认参数一般不用改动,一直下一步下一步直到完成即得到...
下图是甲与其他四种生物β珠蛋白前40个氨基酸的序列比对结果,字母代表氨基酸,“·”表示该位点上的氨基酸与甲的相同,相同位点氨基酸的差异是进化过程中β珠蛋白基因发生突变的结果。下列叙述错误的是A. 不同生物β珠蛋白的基因序列差异可能比氨基酸序列差异更大 B. 位点上未发生改变的氨基酸对维持β珠蛋白功能稳定可能...
首先,使用Clustal X或MEGA做氨基酸序列的多序列比对并将结果保存为.aln或.fasta格式。 随后,预测目的蛋白的三维结构,为了尽量全的展示序列结构,建议使用ITASSAR预测。 下面以人类、小鼠和斑马鱼的sod1多序列比对为例讲解。 1. 用MEGA做多重序列比对并保存.fas格式,将多重序列比对结果拖入或添加入Aligned Sequences, ...
http://weblogo.berkeley.edu/logo.cgi 找到了这个网站
我们熟悉一下序列比对相关的这几个图标和功能。 01 多序列比对 进入WeSeq界面,可直接上传或粘贴需要比对的氨基酸/碱基序列。点击Align菜单,可以使用MAFFT等方法进行序列比对,结果如图所示。可以通过File 菜单的 Export Image 功能导出序列比对图片。 在WeSeq上可以使保守残基显示为*号,具体可以点*击图标,获得如图的序列...
1、准备序列(碱基或者氨基酸) 2、利用clusterx进行序列比对 输入文件: 点击: Alignment---Do complete Alignment 3、比对完成之后,输出比对结果文件 结果文件有2个: **.aln 和 **dnd 4、利用DNAMAN进行绘图 a) 导入刚刚比对好的文件(后缀为aln的比对文件) ...
下图是甲与其他四种生物β-珠蛋白前 40个氨基酸的序列比对结果,字母代表氨基酸,“.”表示该位点上的氨基酸与甲的相同,相同位点氨基酸的差异是进化过程中β-珠蛋白基因发生突变的结果。下列叙述错误的是( )A. 不同生物β-珠蛋白的基因序列差异可能比氨基酸序列差异更大 B. 位点上未发生改变的氨基酸对维持β-珠蛋白...
用Clustal比对后的序列，有时候我们需要转为图片放在文章作详细方析，但大部分人的方法都是直接截图，...
MEGA、DNAStar(MegAlign)、DNAman、T-coffee(http://tcoffee.vital-it.ch/apps/tcoffee/index.html)...