氢氘交换质谱技术的主要流程如下:首先制备蛋白样品,将蛋白样品加入氘原子标记的缓冲液中发生氢氘交换反应(该步需要在不同反应时长下多次进行,以获取全面准确的交换率曲线),反应后的蛋白样品快速进行酶切消化,将得到的肽段进行串联质谱分析,以此推测蛋白质的空间构象和活性位点等。氢氘交换质谱对样品纯度和用量要...
氢氘交换(HDX)质谱技术在很多应用中都能大显身手,包括研究小分子治疗药物如何与目标蛋白质结合,以及表位定位研究。这项技术用溶液中的氘原子替换生物分子主链中的酰胺氢原子,再通过质谱来测量这种变化。 生物分子主链中的酰胺氢原子与溶液中的氘原子发生交换的速率不同,这在一定程度上取决于构型。质谱仪可以测量这些变...
氢氘交换质谱技术的主要流程如下:首先制备蛋白样品,将蛋白样品加入氘原子标记的缓冲液中发生氢氘交换反应(该步需要在不同反应时长下多次进行,以获取全面准确的交换率曲线),反应后的蛋白样品快速进行酶切消化,将得到的肽段进行串联质谱分析,以此推测蛋白质的空间构象和活性位点等。 氢氘交换质谱对样品纯度和用量要求不...
中国科学院上海药物研究所郑杰实验室长期结合生物大分子氢氘交换质谱技术交叉解决由蛋白质(酶)的动力学异常变化所导致的重大疾病的发生机制,聚焦RNA天然免疫模式识别受体的内源,外源性配体识别与信号传导机制,以及自身免疫疾病发生机制。围绕氢氘交换及其应用,以第一作者或通讯作者在Immunity 2021,Anal Chem 2019,Nat Com...
氢氘交换质谱(HDX MS,hydrogen deuterium exchange mass spectrometry)是一种研究蛋白质空间构象的质谱技术。其原理是将蛋白浸入重水溶液中,蛋白的氢原子将于重水的氘原子发生交换,而且蛋白质表面与重水密切接触的氢比位于蛋白质内部的或参与氢键形成的氢的交换速率快,进而通过质谱检测确定蛋白质不同序列片段的氢氘交换...
通过基于Orbitrap Fusion平台的氢氘交换质谱技术(Hydrogen/Deuterium Exchange Mass Spectrometry,HDX-MS),研究人员发现MDA5CARDs和RIG-ICARDs的氢氘交换保护程度依赖于不同长度的K63-polyUbn(MDA5: n≥8; RIG-I: n≥3)而不依赖于K48-polyUbn(n≥10);并且保护强度随着K63-polyUb的长度增加而特异性加强...
氢氘交换质谱技术是一种研究蛋白质空间结构的创新技术。其核心原理是基于蛋白质表面与内部氢原子与重水中的氘原子交换速度不同,通过质谱检测不同交换速率对应的多肽片段,推测蛋白质的三维结构。此技术能快速鉴定蛋白质表面氨基酸,尤其在蛋白相互作用位点、表位活性位点以及表位动态变化研究中具有广泛应用价值...
但是氢氘交换质谱技术有着其他经典方法不具备的优点:首先,可以进行蛋白质结构动态变化的研究是氢氘交换质谱的一个突出优点,包括变化中的活性位点及表位;其次,氢氘交换质谱在蛋白复合体构象的研究中也具有独到的优势;此外,氢氘交换质谱还具有对样品需求量小、纯度要求相对较低、研究对象为溶液环境下的蛋白质的天然构象...
氢氘交换质谱技术就是能捕捉到它们这种交换过程的厉害家伙。它就好像一个超级侦探,能一点点地挖掘出物质的秘密。 比如说,在研究蛋白质的时候,它可就派上大用场啦!蛋白质就像是一个复杂的小机器,有着各种零件和结构。氢氘交换质谱技术能够深入到这个小机器的内部,搞清楚它的各个部分是怎么运作的,是不是很厉害?
表位是蛋白质抗原性的基础,研究蛋白质抗原表位对于设计具有免疫原性和中和活性的新型疫苗分子、新型诊断试剂、多肽、治疗性抗体等具有重要意义。 蛋白研究前沿领域兴起的氢氘交换质谱技术(HDX-MS),可以直接提供哪些氨基酸序列位于蛋白质空间结构的表面位置(包括动态变化中的)、可能的活性位点和蛋白-蛋白相互作用位点等信息...